靶向班氏丝虫谷胱甘肽过氧化物酶(GPx)的抗丝虫分子结构设计与验证:从计算模拟到体外实验的创新策略

【字体: 时间:2025年06月28日 来源:Computers in Biology and Medicine 7.0

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  为解决淋巴丝虫病(LF)现有药物耐药性高、副作用大等问题,研究人员通过结构导向的药物设计,靶向班氏丝虫(Wuchereria bancrofti)关键抗氧化酶谷胱甘肽过氧化物酶(GPx),筛选出特异性结合分子(结合能-7.628至-7.152 kcal/mol),经分子动力学(MD)模拟和体外实验(Setaria digitata模型)验证其抑制活性优于伊维菌素(ivermectin),为开发新型抗丝虫药物奠定基础。

  

淋巴丝虫病(Lymphatic Filariasis, LF)是一种由蚊媒传播的致残性寄生虫病,全球约90%病例由班氏丝虫(Wuchereria bancrofti)引起。现有药物如乙胺嗪(DEC)和伊维菌素(IVM)因耐药性和无法覆盖寄生虫全生命周期而疗效受限。更棘手的是,班氏丝虫通过其抗氧化防御系统(如谷胱甘肽过氧化物酶GPx)中和宿主产生的活性氧(ROS),实现长期存活。这一机制成为药物开发的新靶点,但该酶的三维结构尚未解析,且传统筛选方法效率低下。

针对这一挑战,中央印度大学的研究团队在《Computers in Biology and Medicine》发表研究,首次通过同源建模构建了WbGPx的三维结构,结合分子动力学(MD)模拟评估其稳定性,并采用计算筛选从ChemBridge数据库中发现高亲和力小分子。通过ADMET(吸收、分布、代谢、排泄和毒性)分析和体外实验验证,最终获得优于标准药物的候选分子。

关键技术方法
研究采用模板建模(以小鼠GPx6为模板,PDB ID:7FC2)构建WbGPx结构,经Ramachandran图验证模型质量。通过分子对接筛选ChemBridge数据库,结合100 ns MD模拟分析复合物稳定性,辅以自由能景观(FEL)和“箭猪图”可视化动态变化。体外实验使用牛寄生虫Setaria digitata评估抑制活性,对比伊维菌素的半数抑制浓度(IC50)。

研究结果

  1. WbGPx结构建模与验证
    模板匹配显示WbGPx与小鼠GPx6序列相似度39.59%,模型RMSD仅0.62 ?。活性位点分析证实其依赖半胱氨酸(Cys)而非典型硒代半胱氨酸(Sec)的独特催化机制。

  2. 虚拟筛选与结合特性
    筛选获得多个结合能达-7.628 kcal/mol的分子,其与WbGPx的氢键和疏水相互作用显著强于人源GPx(HsGPx),体现物种选择性。

  3. 动态稳定性分析
    MD模拟显示候选分子使WbGPx结构更紧凑(回旋半径减少12%),关键结合残基如Gly48和Cys102的波动幅度降低50%。

  4. 体外活性验证
    在Setaria digitata模型中,先导分子抑制率超80%,IC50较伊维菌素降低3倍,且无细胞毒性。

结论与意义
该研究首次阐明WbGPx的结构特征及其抗氧化防御机制,并发现靶向该酶的高效抑制剂。通过整合计算与实验验证,不仅解决了传统抗丝虫药物的耐药性问题,还为开发覆盖寄生虫全生命周期的多阶段疗法提供了新思路。Muthusamy Sureshan等作者强调,这一策略可扩展至其他依赖抗氧化系统的热带病治疗,推动全球消除LF的进程。

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