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新型氧吲哚衍生物的虚拟筛选:针对抗菌靶点酶的抗耐药性药物开发
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年06月28日 来源:Current Drug Discovery Technologies CS3.7
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为应对抗菌素耐药性(AMR)这一全球健康威胁,研究人员通过计算机辅助药物设计,对120种新型3-取代-2-氧吲哚衍生物进行虚拟筛选。采用AutoDock Vina评估其与甲硫氨酰-tRNA合成酶(1PFV)和酪氨酰-tRNA合成酶(1JIL)的结合能力,结合ADME/T性质预测和分子动力学(MD)模拟,发现化合物4和6具有优于标准药物(四环素-9.3 kcal/mol、莫匹罗星-7.5 kcal/mol)的强结合活性(-10.1/-10.0 kcal/mol),为开发新型抗菌药物提供先导化合物。
抗菌素耐药性(AMR)被世界卫生组织列为全球公共卫生的首要威胁,预计到2050年将导致超千万人死亡。为破解这一难题,研究者将目光投向新型氧吲哚(oxindole)衍生物的开发。通过结构-活性关系(SAR)分析设计的120种3-取代-2-氧吲哚化合物,经虚拟筛选平台AutoDock Vina评估其与关键靶标——甲硫氨酰-tRNA合成酶(MetRS, 1PFV)和酪氨酰-tRNA合成酶(TyrRS, 1JIL)的结合能力。
采用瑞士ADME(SwissADME)预测药代动力学性质,结合pkCSM和OSIRIS工具进行毒性评估,最终锁定15个优选化合物。令人振奋的是,化合物4和6分别展现出-10.1和-10.0 kcal/mol的强结合能,显著优于临床标准药物四环素(-9.3 kcal/mol)和莫匹罗星(-7.5 kcal/mol)。分子动力学(MD)模拟进一步证实化合物4与靶酶结合的稳定性,其类药性和安全性指标均符合要求。
这项研究不仅证实氧吲哚骨架作为抗菌药物先导化合物的潜力,更建立了一套结合虚拟筛选(VS)、分子对接和ADMET预测的高效药物开发流程,为应对"后抗生素时代"的挑战提供新思路。
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