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甘蔗抗黑穗病关键LncRNAs调控网络解析:共表达基因与转录因子互作机制
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年06月29日 来源:Plant Cell Reports 5.3
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为解决甘蔗抗黑穗病(Sporisorium scitamineum)的分子机制问题,研究人员通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)和顺式靶点解析,构建了LncRNAs与共表达基因的调控网络。研究发现13,861个LncRNAs中,311个与250个基因显著共表达,531个LncRNAs与365个核心转录因子(TFs)互作。GO和KEGG分析揭示这些基因富集于黄酮-黄烷酮生物合成、次生代谢和植物激素信号通路,为甘蔗抗病育种提供了新靶点。
长链非编码RNA(Long non-coding RNAs, LncRNAs)作为植物免疫调控的关键分子,其在甘蔗抵御黑穗病菌(Sporisorium scitamineum)侵染中的作用机制尚不明确。最新研究通过深度测序技术,在病原菌胁迫下的甘蔗中鉴定出13,861个LncRNAs,其中311个与250个靶基因形成显著共表达模块,宛如一场精密的“分子交响乐”。
研究团队运用加权基因共表达网络分析(Weighted Gene Co-expression Network Analysis, WGCNA)和顺式(cis)调控解析,发现这些LncRNAs不仅调控黄酮-黄烷酮生物合成通路(关键抗氧化防御系统),还与365个核心转录因子(Transcription Factors, TFs)形成531对互作关系,如同搭建了一座连接防御信号与发育调控的“基因立交桥”。
特别值得注意的是,29个受LncRNAs调控的核心TFs被锁定为甘蔗抗病应答的“分子开关”。这些发现首次绘制了甘蔗-LncRNAs-病原菌三方博弈的调控图谱,为设计抗病甘蔗新品种提供了“基因导航仪”。
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