解锁传统植物的抗病毒潜力:针对人类偏肺病毒(HMPV)的多方法计算研究

【字体: 时间:2025年06月29日 来源:Journal of Infection and Public Health 4.7

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  本研究针对人类偏肺病毒(HMPV)缺乏靶向治疗药物的现状,通过虚拟筛选、分子对接、分子动力学(MD)模拟、密度泛函理论(DFT)计算和ADMET分析等多方法计算框架,系统评估了传统植物活性成分的抗病毒潜力。研究发现甘草酸(Glycyrrhizin)和睡茄素A(Withaferin A)等化合物具有显著结合亲和力(-65.4 kcal/mol)和良好药代动力学特性,为开发新型HMPV抑制剂提供了重要线索。

  

呼吸道病毒一直是全球公共卫生的重大威胁,其中人类偏肺病毒(HMPV)因其在儿童、老年人和免疫功能低下人群中的高致病性而备受关注。然而,目前临床上既没有针对HMPV的特效疫苗,也缺乏靶向抗病毒药物,常规抗病毒药物开发又面临周期长、成本高和易产生耐药性等问题。在这一背景下,研究人员将目光转向了传统药用植物这一天然活性成分宝库。

为应对这一挑战,研究人员开展了一项创新性的多方法计算研究。研究团队采用虚拟筛选、分子对接、分子动力学(MD)模拟、密度泛函理论(DFT)计算、药效团建模和ADMET(吸收、分布、代谢、排泄和毒性)分析等综合计算框架,系统评估了传统植物活性成分对抗HMPV的潜力。

研究首先通过虚拟筛选从传统植物中筛选出潜在活性成分,随后采用分子对接技术评估这些成分与HMPV基质蛋白(PDB ID: 5WB0)的结合能力。分子动力学模拟(2000 ns)用于分析蛋白质-配体复合物的稳定性,而DFT计算则揭示了化合物的电子特性。最后通过ADMET分析评估了候选化合物的药代动力学和安全性特征。

在分子对接研究中,甘草酸(Glycyrrhizin)表现出最强的结合亲和力(-65.4 kcal/mol),其次是睡茄素A(Withaferin A)(-63.7 kcal/mol)。分子动力学模拟显示,这些复合物具有优异的稳定性,甘草酸的均方根偏差(RMSD)仅为1.3 ?。DFT分析证实了这些化合物的良好电子特性,而ADMET分析验证了其类药特性。

动态交叉相关矩阵(DCCM)分析揭示了配体结合对蛋白质构象的影响,而分子静电势(MESP)图谱则标明了分子表面的静电势分布,为优化设计提供了依据。药效团模型确定了氢键供体/受体、疏水区域和芳香环等关键特征。

ADMET分析显示,甘草酸和睡茄素A具有良好的口服生物利用度(分别为78%和85%)和适度的血脑屏障穿透性。虽然睡茄素A显示出一定的肝毒性,但其治疗指数(TI)较高,表明在治疗剂量范围内相对安全。

这项研究的重要意义在于:首先,它证实了传统植物活性成分作为抗HMPV药物的巨大潜力;其次,研究建立的多方法计算框架为加速抗病毒药物发现提供了有效策略;最后,研究鉴定的先导化合物为后续实验验证和临床转化奠定了基础。

论文发表在《Journal of Infection and Public Health》上的这项研究,不仅为开发新型抗HMPV药物提供了重要线索,也展示了计算生物学在药物发现中的强大应用价值。未来研究应着重对这些先导化合物进行体外和体内验证,并探索其与其他抗病毒药物的协同效应,以期为HMPV感染提供更有效的治疗方案。

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