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绿豆产量相关性状的遗传解析:基于QTL测序方法的综合研究
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年06月29日 来源:Journal of Plant Physiology 4.0
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为解决绿豆产量性状遗传基础不明的问题,研究人员通过构建重组自交系(RIL)群体,结合GCIM/MQM/ICIM三种QTL定位方法,在3种环境下鉴定出120个与百粒重(HSW)、单荚粒数(SPP)、荚长(PL)、荚宽(PW)和单株产量(YP)相关的QTL,其中10个为环境稳定的核心QTL,并预测了候选基因,为分子设计育种提供理论框架。
绿豆作为兼具营养价值和生态效益的短周期豆科作物,在全球粮食安全体系中扮演着独特角色。其种子富含蛋白质(24-28%)和抗氧化活性物质,既是亚洲传统饮食的重要补充,又是"药食同源"的功能性作物。然而令人担忧的是,尽管全球栽培面积持续扩大,绿豆单产却长期停滞在1.2吨/公顷的低水平,成为制约产业发展的关键瓶颈。这种低产现状与两大科学问题密切相关:其一,产量构成性状如百粒重(HSW)和单荚粒数(SPP)受多基因调控且易受环境影响,遗传机制复杂;其二,现有研究中稳定可靠的产量相关数量性状位点(QTL)报道不足,分子育种缺乏精准靶点。
针对这一科学难题,太原师范学院生物科学与技术学院的研究团队在《Journal of Plant Physiology》发表重要成果。该研究选用具有显著表型差异的绿豆地方品种SX36(高产型)和AH20(低产型)构建包含233个家系的重组自交系(RIL)群体,通过多环境表型鉴定与高通量基因型分析,系统解析了5个核心产量性状的遗传架构。
研究采用三大关键技术:首先,在山西、河南和山东三地设置重复试验,获取HSW、SPP、PL、PW和YP的表型数据;其次,运用基因组水平复合区间定位(GCIM)、多QTL映射(MQM)和包容性复合区间定位(ICIM)三种算法进行交叉验证;最后基于绿豆参考基因组Vradi_ver6进行候选基因预测。
【Recombinant inbred line population】
通过单粒传法构建的RIL群体覆盖绿豆7条染色体,基因型分析显示多态性标记均匀分布。亲本SX36在所有测试性状上均显著优于AH20(P<0.01),如百粒重相差达42.6%,为QTL定位提供理想材料基础。
【Phenotypic characterization】
三环境表型分析揭示所有性状均呈现连续变异且符合正态分布,广义遗传力达74.21-79.16%,证实遗传因素主导表型变异。值得注意的是,PL与HSW、SPP均呈显著正相关(r=0.68和0.59),暗示荚形态可能是产量提升的关键突破点。
【QTL定位结果】
共检测到120个QTL,包括33个HSW-QTL和20个YP-QTL。其中10个QTL(如qHSW5-3和qYP7-3)在三环境和三种算法中均被重复检测,LOD值最高达8.92,表型贡献率(R2)介于10.3-15.8%。这些"核心QTL"集中在2、5、7号染色体,形成3个产量性状调控热点区域。
【候选基因分析】
在qHSW5-3区间预测到种子发育关键基因VrCYCD3(细胞周期调控子)和VrSWEET10(糖转运蛋白)。qPL7-3内发现与细胞伸长相
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