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基于微阵列数据解析EBV相关结外NK/T细胞淋巴瘤的发病机制及关键枢纽基因
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年06月29日 来源:Leukemia Research 2.1
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本研究通过分析GEO数据库中ENKL(结外自然杀伤/T细胞淋巴瘤)与EBV(Epstein-Barr病毒)感染的基因表达谱(GSE85599和GSE169644),筛选出152个差异表达基因(DEGs),并鉴定出TOP2A、AURKB等14个枢纽基因。通过PPI网络和富集分析揭示这些基因与核过程密切相关,为阐明EBV感染致ENKL的分子机制提供了新靶点。
研究背景与意义
结外自然杀伤/T细胞淋巴瘤(ENKL)是一种侵袭性强、预后差的罕见非霍奇金淋巴瘤,其发病与Epstein-Barr病毒(EBV)感染高度相关。尽管EBV在全球感染率超过95%,但仅少数个体发展为ENKL,提示遗传易感性和分子机制尚未明确。目前,EBV如何调控ENKL发生发展的关键基因网络仍是领域内亟待解决的难题。
研究方法与技术路线
研究人员从GEO数据库获取ENKL(GSE85599)和EBV感染(GSE169644)的微阵列数据集,利用GEO2R工具筛选差异表达基因(DEGs),通过STRING数据库构建蛋白互作网络(PPI),并采用Cytoscape软件鉴定枢纽基因。DAVID数据库用于基因功能富集分析。
研究结果
讨论与展望
该研究首次系统揭示ENKL与EBV共有的分子特征,14个枢纽基因可能成为诊断标志物或治疗靶点。例如,TOP2A和AURKB是已知的抗癌药物靶点,其过表达提示ENKL患者或可从相关抑制剂中获益。未来需通过临床样本验证这些基因的调控机制,并探索其与EBV潜伏感染(如LMP1蛋白)的相互作用。
局限性:研究依赖公共数据库样本,需补充体外实验验证基因功能。论文发表于《Leukemia Research》,为ENKL的精准诊疗提供了理论依据。
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