
-
生物通官微
陪你抓住生命科技
跳动的脉搏
LINC01270/miR-29c-3p/LOX轴通过ceRNA机制调控胃癌进展的生物信息学分析与实验验证
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年06月29日 来源:Biochemistry and Biophysics Reports 2.3
编辑推荐:
推荐:本研究针对胃癌(GC)高死亡率与复发率难题,通过整合生物信息学分析和实验验证,首次揭示LINC01270通过竞争性内源RNA(ceRNA)机制吸附miR-29c-3p,解除其对LOX基因的抑制,从而驱动胃癌进展。该发现为GC诊断提供新型生物标志物(AUC=0.85),并为靶向干预LOX信号通路提供理论依据。
胃癌作为全球第五大癌症死因,其高复发率和转移特性始终是临床治疗的重大挑战。尽管近年来诊疗技术取得进展,晚期患者预后仍不理想,这促使科学家不断探寻新的分子靶点。在胃癌发生发展中,细胞外基质(ECM)重塑和上皮间质转化(EMT)是关键环节,而赖氨酰氧化酶(LOX)家族作为ECM核心调控因子,其过表达与肿瘤侵袭转移密切相关。然而,LOX在胃癌中的上游调控机制尚不明确。近年兴起的竞争性内源RNA(ceRNA)理论为解析该问题提供了新视角——长链非编码RNA(lncRNA)可能通过"分子海绵"作用吸附微小RNA(miRNA),间接调控靶基因表达。
为揭示LOX异常激活的ceRNA调控网络,来自德黑兰医科大学的研究团队开展了系统性研究。通过整合TCGA-STAD和GTEx数据库的生物信息学分析,结合胃癌组织样本验证和KATO III细胞实验,首次构建了LINC01270/miR-29c-3p/LOX调控轴,相关成果发表在《Biochemistry and Biophysics Reports》。
研究采用多组学技术路线:通过GEPIA、miRDB等数据库筛选LOX相关miRNA;利用MiRNet预测lncRNA-miRNA互作;采用qRT-PCR检测30对胃癌/癌旁组织中LINC01270、miR-29c-3p和LOX表达;通过siRNA沉默KATO III细胞的LINC01270,观察下游分子变化及细胞活力改变。
研究结果揭示:
生物信息学预测发现TUG1和LINC01270/miR-29c-3p轴构成LOX上游网络
整合分析显示LOX在胃癌组织显著高表达。通过三大数据库交叉验证锁定miR-29c-3p为LOX关键调控因子,其与LOX存在3个高亲和力结合位点。进一步预测发现LINC01270与miR-29c-3p具有4个相互作用区域。
LINC01270/miR-29c-3p/LOX在临床样本中的失调
qRT-PCR证实胃癌组织中LINC01270和LOX表达显著上调(P<0.0001),而miR-29c-3p明显下调(P=0.0004)。相关性分析显示LINC01270与LOX呈正相关(r=0.7715),与miR-29c-3p呈负相关(r=-0.4911)。
诊断价值评估
ROC曲线分析表明LINC01270区分胃癌的AUC达0.85(P<0.0001),miR-29c-3p和LOX的AUC分别为0.7578和0.81。临床关联分析发现miR-29c-3p低表达与淋巴结转移显著相关(P=0.03)。
功能验证实验
siRNA沉默LINC01270后,KATO III细胞的miR-29c-3p表达上调2.71倍(P=0.003),LOX下调0.61倍(P<0.05),细胞活力降低至62%(P=0.03),证实该轴的生物学功能。
该研究创新性地揭示了LINC01270通过ceRNA机制调控LOX表达的新途径:LINC01270作为"分子海绵"吸附miR-29c-3p,解除其对LOX mRNA的抑制作用,进而促进ECM重塑和肿瘤进展。与既往研究相比,该发现有三方面突破:首次将LOX异常表达与LINC01270-ceRNA机制关联;证实miR-29c-3p低表达与淋巴结转移的临床相关性;提供LINC01270作为诊断标志物的实验证据(AUC=0.85)。
尽管存在样本量有限、缺乏体内实验等局限,但研究通过多维度验证构建了完整的"生物信息预测-临床样本验证-功能实验"证据链。未来研究可扩大样本验证临床价值,或开发靶向LINC01270的核酸药物。该成果不仅深化了对胃癌ceRNA网络的认识,也为开发新型诊断标志物和靶向治疗策略提供了理论依据。
生物通微信公众号
知名企业招聘