喜马拉雅山麓与印度北部平原地区Cordia dichotoma遗传多样性及种群结构的ISSR标记分析

为解决Cordia dichotoma（一种具有重要药用和食用价值的未充分利用植物）因自然种群锐减导致的遗传资源流失问题，研究人员通过ISSR分子标记技术对来自喜马拉雅山麓和印度北部平原的60份种质资源进行遗传多样性分析。研究发现该物种存在3个基因库，并筛选出K8、H4等6份高多样性种质，为后续育种和保育提供了关键靶标。该研究首次系统解析了C. dichotoma的遗传结构，为这一濒危资源的可持续利用奠定了分子基础。

　　

在印度传统医学和饮食文化中，Cordia dichotoma（俗称Lasura）的果实、叶片和花朵被广泛食用，其多糖胶质和铬元素具有抗糖尿病等药用价值。然而这种宝库般的植物正面临严峻危机——城市化进程和人为忽视导致其野生种群急剧萎缩，更令人担忧的是，学界对其遗传背景认知几乎空白。这种现状严重制约了该物种的科学保护和可持续开发。面对这一困境，Sant Baba Bhag Singh大学的研究团队首次采用ISSR（Inter-Simple Sequence Repeat）分子标记技术，对采自喜马拉雅山麓和旁遮普平原的60份种质展开系统性遗传解析，相关成果发表于《Ecological Genetics and Genomics》。

研究采用10条ISSR引物对样本DNA进行PCR扩增，通过凝胶电泳分析多态性片段。主要技术路线包括：从印度喜马偕尔邦和旁遮普省7个地区采集叶片样本；CTAB法提取基因组DNA；筛选具有多态性的ISSR引物；计算多态信息含量（PIC）、Nei基因多样性指数等参数；利用聚类分析揭示种群结构。

【ISSR polymorphisms】
10条引物共扩增出72个多态性片段（250-2000 bp），平均每条引物产生7.2个片段。其中UBC-807引物扩增效率最高（12个片段），UBC-810最低（4个片段）。多态信息含量PIC值介于0.32（UBC-848）至0.49（UBC-808）之间，平均0.44，表明所用引物具有较好鉴别力。

【Genetic structure】
Hoshiarpur种群展现出最高遗传多样性（Nei指数0.268，Shannon指数0.399）。STRUCTURE分析揭示存在3个基因库，系统发育树显示种质明显分为两大分支。这种遗传分化可能与地理隔离和生态适应性有关。

【Conservation implications】
研究强调必须采取原地（in situ）和迁地（ex situ）相结合的保育策略。特别指出K8、H4、H7、H10、M21和M62等6份高多样性种质可作为核心种质库，用于未来育种计划和生态恢复工程。

该研究首次绘制了C. dichotoma在印度关键分布区的遗传图谱，其创新性体现在三方面：证实ISSR标记在该物种遗传分析中的有效性；发现种群间显著的遗传分化；建立可量化评价种质资源的指标体系。这些发现不仅填补了Boraginaceae科植物分子生态学研究的空白，更为制定科学的保护策略提供了分子依据。随着后续功能基因挖掘和品种改良工作的推进，这项基础研究或将唤醒这个"被遗忘的物种"在医药、食品等领域的巨大潜力。