基于叶绿体全基因组分析的x=9型花生属物种遗传关系解析及其系统发育意义

为解决x=9型花生属物种基因组组成和系统关系不明的问题，研究人员通过比较叶绿体全基因组（plastome）分析，揭示了Arachis属中x=9物种（A. decora、A. praecox、A. palustris和A. porphyrocalyx）的保守性特征与特殊聚类模式，发现A. porphyrocalyx意外与A基因组物种亲缘更近。该研究为花生属种质资源保护与利用提供了关键基因组学依据。

　　

花生属（Arachis L.，豆科Fabaceae）作为包含栽培花生（A. hypogaea）等重要油料作物的多样化类群，其84个物种中x=9型二倍体的基因组特征长期未被阐明。研究者对来自Arachis组的A. decora、A. praecox、A. palustris和Erectoides组的A. porphyrocalyx进行叶绿体全基因组测序，发现这些plastome长度介于156,272–156,391 bp之间，均含76个蛋白编码基因、29个tRNA和4个rRNA，GC含量稳定在36.4%。分析显示94-101个简单序列重复（SSR）位点，且单拷贝区/反向重复区（SC/IR）边界高度保守。系统发育树意外揭示：本应与Erectoides组聚类的A. porphyrocalyx，竟与Arachis组的A基因组物种“称兄道弟”，而x=9物种则自成单系群。这项研究如同给花生家族做了次“基因族谱鉴定”，不仅破解了染色体基数差异导致的演化谜题，更为野生花生种质库的“户口登记”提供了分子身份证。