中国家族性桥小脑发育不全11型新致病基因TBC1D23的鉴定与功能研究揭示表型异质性机制

【字体: 时间:2025年06月30日 来源:Human Genomics 3.8

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  本研究针对桥小脑发育不全11型(PCH11)的临床异质性难题,通过全外显子测序(WES)在中国家系中发现TBC1D23基因新型纯合移码突变c.511_512delTT(p.F171Qfs*8)。研究人员利用斑马鱼模型和细胞实验证实该突变转录本部分逃逸无义介导的mRNA降解(NMD),产生异常稳定的截短蛋白,其错误定位和细胞增殖抑制效应加剧了表型严重程度。该发现为PCH11的分子诊断和精准治疗提供新靶点,发表于《Human Genomics》。

  

桥小脑发育不全(PCH)是一组严重影响神经发育的遗传性疾病,其中PCH11型由TBC1D23基因突变引起。尽管已知TBC1D23突变导致PCH11,但患者间显著的临床异质性——从轻度运动障碍到完全丧失行走能力——暗示存在未被阐明的分子机制。更棘手的是,传统观点认为这类疾病单纯由基因功能丧失(LoF)引起,但为何相同基因的不同突变会导致差异如此巨大的临床表现?这个"基因型-表型黑箱"成为困扰临床遗传学的难题。

为解开这个谜团,同济大学医学院的研究团队对一个中国近亲婚配家系展开研究。该家系两名患儿表现出极端严重的PCH11表型:不仅存在典型的小脑和脑桥发育不良、胼胝体变薄,还伴有攻击性行为和完全的运动功能丧失。通过全外显子测序和共分离分析,研究人员首次鉴定出TBC1D23基因第5外显子的纯合双碱基缺失突变c.511_512delTT,导致第171位苯丙氨酸被谷氨酰胺替代并引入提前终止密码子(p.F171Qfs*8)。这个突变位点位于TBC结构域内,在进化中高度保守,生物信息学预测其具有致病性。

研究采用多学科交叉策略,关键技术包括:1) CRISPR/Cas9构建斑马鱼同源突变模型;2) 定量PCR检测突变转录本的NMD逃逸效率;3) 免疫荧光观察截短蛋白的亚细胞定位;4) CCK-8法分析细胞增殖影响;5) 生物信息学预测蛋白降解信号。样本来源于中国PCH11家系成员外周血。

临床表型与遗传鉴定
MRI显示患儿小脑和脑桥严重发育不良,胼胝体变薄程度超过既往报道。基因分析发现该突变在家系中符合隐性遗传模式,且未见于公共数据库。

斑马鱼模型揭示NMD逃逸


通过构建携带人类同源突变的斑马鱼,发现突变转录本仅被NMD部分降解(残留约50%),提示截短蛋白可能持续产生。

截短蛋白的异常特性


该截短蛋白(仅保留部分TBC结构域)表现出:1) 异常稳定性——Western blot显示其表达量是野生型的2倍;2) 完全丧失高尔基体定位能力;3) 显著抑制HeLa细胞增殖。生物信息学分析揭示其C端降解信号(PEST序列和泛素化位点)的丢失可能是稳定性增加的原因。

讨论与意义
这项研究突破性地提出"复合致病机制":既有的LoF理论不能完全解释PCH11的表型异质性,而c.511_512delTT突变通过双重途径导致严重表型——一方面TBC1D23功能完全丧失(截短蛋白无法定位高尔基体),另一方面逃逸NMD的截短蛋白异常累积并抑制细胞增殖。这为理解神经发育疾病的基因型-表型关联提供了新范式:截短蛋白的毒性增益功能(gain-of-toxicity)可能放大单纯LoF的病理效应。

临床转化方面,该发现提示:1) 基因诊断需关注突变位点与NMD效率的关系;2) 针对特定突变可开发NMD调节剂或降解截短蛋白的靶向疗法。研究还扩充了PCH11的突变谱,为遗传咨询提供新依据。未来需要在患者来源的iPSC神经元中验证这些发现,并探索不同突变类型与NMD效率的规律性关联。

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