LM-GlycoRepo Version 1.0：基于凝集素微阵列的小鼠组织糖组图谱数据存储新系统

【编辑推荐】针对糖组学数据缺乏标准化存储系统的问题，研究人员开发了符合FAIR原则和MIRAGE指南的LM-GlycoRepo系统，专门存储激光显微切割(LMD)辅助的凝集素微阵列(LMA)数据，支持图像与实验数据的上传，并创新性引入"数据禁运"机制以匹配论文评审周期。该系统通过GlyCosmos门户开放访问，未来将拓展至人类样本研究。

　　

在生命科学研究中，蛋白质糖基化修饰的解析一直是揭示细胞通讯奥秘的关键。凝集素微阵列(Lectin Microarray, LMA)技术因其高灵敏度成为糖组图谱研究的利器，但海量数据的存储与共享却面临严峻挑战——现有系统难以满足FAIR（可发现、可访问、可互操作、可重用）原则，且缺乏符合国际糖组学实验最低信息标准(MIRAGE)的专用平台。

针对这一瓶颈，研究人员开发了革命性的LM-GlycoRepo系统。该系统1.0版本专注于小鼠组织糖组图谱数据，支持激光显微切割(Laser Microdissection, LMD)获取的样本图像、LMA原始数据及高分辨率凝集素染色图像的上传。其创新性的"数据禁运"功能尤为亮眼，允许研究者设置数据公开时间，完美匹配学术论文的同行评审周期。更值得一提的是，解禁后的数据可直接通过现有可视化工具LM-GlycomeAtlas进行交互分析。

研究团队采用标准化LMD-LMA工作流程，确保数据质量符合MIRAGE标准。系统架构设计包含三个核心模块：数据上传接口支持多模态LM数据提交，元数据管理系统强制要求实验参数标准化录入，而时间戳功能则实现数据发布的精确控制。所有数据通过GlyCosmos门户（https://lm-glycorepo.glycosmos.org/lm_glycorepo/）开放共享。

主要研究发现包括：

1. 系统架构设计：采用分层存储模式，原始数据与元数据分离管理，确保数据可追溯性；
2. 数据兼容性验证：成功整合20种小鼠组织的LMD-LMA数据集，证明系统对复杂糖组数据的处理能力；
3. 时间控制机制：测试显示"禁运"功能可精确到分钟级，满足不同期刊的embargo政策需求；
4. 可视化对接：验证了与LM-GlycomeAtlas的无缝衔接，用户可直接生成组织特异性糖链表达热图。

这项发表于《Journal of Proteome Research》的研究具有里程碑意义：首次建立了符合MIRAGE标准的糖组学专用存储系统，其模块化设计为未来扩展人类样本数据预留了空间。系统实现的FAIR化管理将加速糖组学数据的跨研究组比对，而禁运机制则为学术优先权保护提供了新范式。随着更多生物样本数据的接入，LM-GlycoRepo有望成为糖科学领域的核心基础设施。