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巴西濒危树种Plinia edulis参考基因组破译:开启药用与营养价值的分子宝库
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月01日 来源:Molecular Genetics and Genomics 2.3
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来自巴西的研究人员针对濒危物种Plinia edulis的基因组资源匮乏问题,完成了该树种的参考基因组测序与注释。研究获得N50达21.2 Mb的高质量基因组(BUSCO完整性98.5%),预测37,428个基因模型并鉴定327条次级代谢物合成通路,包括59条萜烯/聚酮化合物及40条苯丙素/黄酮代谢通路。通过KEGG分析锁定20种药理活性次级代谢产物的关键基因,开发30,897个SSR标记位点。该成果为物种保育、分子育种及药用成分开发提供核心数据支撑。
在热带雨林的绿色宝库中,巴西大西洋沿岸的特有濒危树种——食用普利尼亚(Plinia edulis)终于揭开了其基因密码。科研团队运用现代测序技术,成功组装出该物种首个参考基因组,其连续性指标N50突破21.2兆碱基(Mb),核心基因集完整性(BUSCO)高达98.5%。
令人振奋的是,37,428个精准预测的基因模型中,藏着327条次级代谢物合成的分子流水线,包括制造植物"化学武器"的59条萜烯(terpenoids)和聚酮化合物(polyketides)通路,以及40条与抗氧化息息相关的苯丙素(propanoids)和黄酮(flavonoids)代谢网络。通过京都基因百科全书(KEGG)的导航系统,研究者锁定了20种具有药用潜力的活性成分生产车间——这些分子机器可能成为未来抗炎、抗癌药物的新型原料。
为加速品种改良,团队还绘制了30,897个微卫星(SSR)分子路标,其中75%可作为遗传多样性分析的黄金位点。这项研究不仅为这个"水果药箱"的保育按下快进键,更打开了从分子农场采收营养药物(nutraceutical)的无限可能。当气候变化威胁森林家园时,这些基因密码或许还能帮助普利尼亚练就应对环境压力的生存绝技。
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