
-
生物通官微
陪你抓住生命科技
跳动的脉搏
基于单晶X射线与人工智能的化合物C73抗癌潜力多维度评价研究
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月01日 来源:Journal of Molecular Structure 4.0
编辑推荐:
本研究通过整合单晶X射线衍射、密度泛函理论(DFT)、分子对接及AI预测技术,系统评估了抗阿尔茨海默病候选化合物C73的结构稳定性与抗癌机制。研究发现C73通过F···H(26.9%)等相互作用维持晶体稳定性,其HOMO-LUMO能隙(0.05523 eV)表明高稳定性,并靶向EGFR(-10.51 kcal/mol)、SRC等关键蛋白,为抗癌先导化合物开发提供了新思路。
在药物研发领域,传统方法面临耗时耗资、靶点筛选效率低等挑战。人工智能(AI)与多学科交叉技术为加速药物发现提供了新路径。化合物C73最初作为抗阿尔茨海默病候选分子被设计,但其潜在抗癌活性尚未探索。为此,研究人员采用单晶X射线衍射、量子化学计算与系统药理学相结合的策略,首次全面解析了C73的结构特性与抗癌机制。
研究团队运用单晶X射线衍射确定晶体结构,通过Hirshfeld表面分析量化分子间作用力,采用B3LYP/6-311G(d,p)基组进行密度泛函理论(DFT)计算,结合网络药理学预测靶点,并利用分子对接与100 ns分子动力学模拟(MD)验证结合稳定性。
晶体结构与电子特性
晶体学分析显示C73为正交晶系(空间群Pbca),关键键长C=O(1.225–1.233 ?)与DFT计算结果高度吻合。Hirshfeld分析揭示F···H(26.9%)是主要晶体稳定力,分子静电势(MEP)显示O26/O33为亲电区域。前沿分子轨道(FMO)分析表明0.05523 eV的HOMO-LUMO能隙赋予分子高稳定性与适度反应活性。
靶点预测与机制
网络药理学筛选出109个潜在靶点,构建包含EGFR、SRC、JAK2等核心节点的蛋白互作网络(106节点/288边)。KEGG富集提示C73可能通过ErbB、凋亡等通路作用于非小细胞肺癌。
分子相互作用验证
分子对接显示C73与EGFR(-10.51 kcal/mol)、SRC(-11.07 kcal/mol)强结合,MM-GBSA计算结合能达-69.30 kcal/mol(SRC)。100 ns分子动力学模拟证实复合物稳定性,主成分分析(PCA)显示构象集中分布。
该研究首次证实C73通过多靶点作用机制展现抗癌潜力,其晶体学与电子特性数据为后续结构优化提供了精确模板。AI驱动的系统药理学与实验验证相结合的策略,为加速抗癌药物研发提供了范式。论文发表于《Journal of Molecular Structure》,为基于结构理性的多靶点药物设计提供了重要案例。
生物通微信公众号
知名企业招聘