综述:转座元件的转录及转录后调控机制及其在发育与疾病中的作用

【字体: 时间:2025年07月01日 来源:Nature Reviews Molecular Cell Biology

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  (编辑推荐)这篇综述系统阐释了转座元件(TEs)在人类基因组中的双重角色:既受多层转录(如表观沉默)和转录后(如RNAi)机制抑制,又能逃逸调控成为发育关键调控因子。文章揭示了TEs在癌症和神经疾病中异常激活的病理机制,并展望了基于TE靶向(如肿瘤特异性抗原免疫疗法)的创新治疗策略。

  

转座元件的基因组占比与调控悖论

人类和其他哺乳动物基因组中近50%由转座元件(TEs)构成。这些曾被Barbara McClintock称为“控制元件”的DNA序列,如今被证实具有复杂的调控功能。高通量测序技术揭示,TEs既能干扰基因表达导致疾病,又能通过顺式调控元件(如增强子)参与发育编程,形成基因组进化的“双刃剑”特性。

多层防御机制:从表观沉默到RNA监控

细胞通过多层级机制抑制TE活性:

  1. 转录层面:DNA甲基化(如CpG岛甲基化)和组蛋白修饰(H3K9me3异染色质化)沉默TE启动子;
  2. 转录后层面:RNA干扰(RNAi)通路和小RNA(如piRNA)介导的TE mRNA降解。值得注意的是,某些内源性逆转录病毒(ERVs)可通过产生非编码RNA(如lncRNA)逃逸沉默,甚至调控宿主基因剪接。

发育中的“叛逃者”:TE的生理功能

近期研究发现,特定TE家族(如LINE-1)在胚胎早期发育中阶段性激活:

  • 灵长类特有的HERV-K通过提供合胞素(syncytin)基因促进胎盘形成;
  • 小鼠2细胞期胚胎中MERVL转座子激活驱动全能性相关基因(如Zscan4)表达。这些案例印证了TEs作为“进化工具箱”的生物学意义。

疾病关联:从癌症到神经退行

TE异常激活与多种疾病密切相关:

  • 癌症:全基因组低甲基化导致ALU元件广泛转录,产生肿瘤特异性抗原(TSAs),成为免疫检查点抑制剂(如抗PD-1疗法)的新靶点;
  • 神经疾病:额颞叶痴呆(FTD)患者脑中SINE元件异常插入TDP-43基因,引发蛋白毒性聚集。

治疗新策略:靶向TE的精准干预

基于TE的临床转化研究包括:

  1. 表观重编程:DNMT抑制剂(如5-aza)选择性激活沉默的TE增强子;
  2. 免疫疗法:针对ERV衍生的新抗原(如MLV-Env)的CAR-T设计;
  3. 反义寡核苷酸(ASO):特异性阻断致病性TE RNA翻译。这些策略为“垃圾DNA”的临床价值提供了全新视角。
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