印度人群口腔癌与烟草滥用者唾液微生物组及功能特征分析：生物信息学驱动的生物标志物发现

本研究针对印度人群口腔鳞状细胞癌(OSCC)患者、烟草滥用者及健康人群，通过16S rRNA测序结合QIIME2和MicFunPred分析，揭示了唾液微生物组多样性降低、促炎菌群（如Porphyromonas、Streptococcus）富集等特征，并发现OSCC组中细菌趋化性、LPS合成等通路显著激活。该研究为OSCC的早期诊断提供了非侵入性微生物标志物，为精准医疗开辟了新路径。

　　

口腔鳞状细胞癌(OSCC)是全球范围内最具侵袭性的恶性肿瘤之一，五年生存率长期徘徊在50%-60%。在印度等发展中国家，烟草滥用与OSCC发病的关联尤为显著。尽管传统研究聚焦于遗传和环境因素，但近年来，人体微生物组——尤其是口腔这一仅次于肠道的第二大多样性微生物生态系统——被发现在癌症发生中扮演关键角色。口腔中定植的700余种细菌、100多种真菌以及原生生物，通过慢性炎症、免疫逃逸和基因毒性代谢产物等机制参与致癌过程。然而，针对印度人群这一OSCC高发群体的口腔微生物特征研究仍属空白，且烟草如何通过改变微生物组促进OSCC的机制尚不明确。

诺伊达Jaypee信息技术学院生物技术系的研究团队在《Archives of Oral Biology》发表论文，首次系统比较了印度OSCC患者、烟草滥用者和健康人群的唾液微生物组差异。研究从印度生物数据中心(IBDC)获取16S rRNA基因序列，采用QIIME2进行物种注释，通过MicFunPred预测功能，结合α/β多样性分析和差异丰度检验，揭示了微生物群落结构与功能通路的特异性改变。

研究设计
研究纳入10例经病理确诊的OSCC患者、11例长期烟草滥用者和10例健康对照，所有样本均来自IBDC。通过Illumina平台进行16S rRNA基因V3-V4区测序，使用DADA2进行质量控制，Silva数据库进行物种注释。功能预测采用KEGG和MetaCyc数据库。

微生物多样性
OSCC组表现出最显著的α多样性降低（Shannon指数p<0.01），β多样性分析显示三组形成独立聚类（PERMANOVA p=0.001）。烟草组呈现独特的"高丰富度"模式，Prevotella和Veillonella相对丰度较健康组提升2.3倍。

关键菌群
OSCC组中Porphyromonas gingivalis（与牙周炎相关）富集达4.8倍，Streptococcus mutans（产酸菌）增加3.2倍。值得注意的是，Parvimonas micra（DNA损伤诱导菌）仅在OSCC组检测到。烟草组则以Peptostreptococcus anaerobius（耐氧应激菌）为标志。

功能通路
OSCC样本中细菌趋化性（ko02030）和脂多糖合成（ko00540）通路显著激活（q<0.05）。烟草组中谷胱甘肽代谢（ko00480）和细胞色素P450通路（ko00980）上调，反映氧化应激适应机制。

讨论与意义
该研究首次建立了印度人群OSCC特异的"微生物-功能"关联图谱：1）Porphyromonas/Streptococcus富集与慢性炎症的正反馈循环；2）烟草诱导的微生物组重塑通过持续氧化应激促进癌变；3）Parvimonas可能作为OSCC特异性诊断标志物。这些发现为开发基于唾液的OSCC早期筛查工具提供了理论依据，同时提示调节口腔菌群或可成为辅助治疗新策略。研究局限性在于样本量较小，未来需扩大队列验证标志物的普适性。