尼日利亚奥卢索森垃圾场固体废物渗滤液中细菌群落的16S rRNA扩增子测序分析及其环境管理启示

【字体: 时间:2025年07月01日 来源:Microbiology Resource Announcements 0.7

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  来自尼日利亚的研究人员针对垃圾渗滤液污染问题,通过16S rRNA基因测序解析奥卢索森垃圾场渗滤液的细菌群落结构。研究发现优势菌门为酸杆菌门(Acidobacteria, 14.65%)、浮霉菌门(Planctomycetes, 7.15%)和变形菌门(Proteobacteria, 3.28%),71.64%菌群未明确分类。该研究为发展中国家垃圾渗滤液微生物治理提供重要数据支持。

  

最新研究揭示了尼日利亚拉各斯奥卢索森垃圾场固体废物渗滤液(SWL)中独特的微生物生态图谱。通过Illumina MiSeq平台对V3-V4可变区进行16S rRNA基因测序,采用DADA2算法生成扩增子序列变异体(ASVs),突破传统97%相似度的操作分类单元(OTU)聚类限制。

数据分析显示,渗滤液中存在大量未分类细菌(71.64%),已知优势菌群包括:嗜酸菌门(Acidobacteria)占14.65%,能降解复杂有机物;浮霉菌门(Planctomycetes)占7.15%,具有厌氧氨氧化潜力;变形菌门(Proteobacteria)占3.28%,包含多种污染物降解菌。测序获得296,086条reads,平均长度173,888 bp,GC含量57.86%,Chao1多样性指数达256.272。

研究团队使用ZR Fungal/Bacterial DNA Kit提取DNA,引物341F/785R扩增,经Trimmomatic质控和QIIME2分析。该发现为理解垃圾渗滤液微生物组及其在生物修复中的应用奠定基础,尤其对热带地区垃圾填埋场管理具有指导价值。南非Inqaba生物技术实验室提供了测序技术支持。

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