基于计算机模拟筛选天然STAT5A二聚化抑制剂:靶向SH2结构域的前列腺癌治疗新策略

【字体: 时间:2025年07月01日 来源:Anti-Cancer Agents in Medicinal Chemistry 2.4

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  本研究针对前列腺癌(PCa)治疗中STAT5A/b二聚化关键靶点SH2结构域,通过计算机辅助药物设计筛选天然抑制剂。研究人员采用同源建模构建STAT5A(VP1P)三维结构,结合药效团筛选和分子对接技术,从ZINC数据库500种天然化合物中鉴定出Pedunculagin(-10.5 kcal/mol)等5种高结合能候选分子。ADMET分析和100 ns分子动力学(MD)模拟证实其与STAT5抑制剂(临床II期)类似,能稳定结合Arg638关键位点,为开发新型STAT5A/b二聚化阻断剂提供先导化合物。

  

这项开创性研究聚焦信号转导和转录激活因子5A(STAT5A)的二聚化过程——前列腺癌发展的关键分子事件。科学家们锁定STAT5A/b最保守的Src同源2(SH2)结构域(氨基酸573-712),该区域既是受体特异性招募的"分子密码",又是二聚化形成的"结构开关"。

研究团队运用多尺度计算生物学手段:首先通过模板同源建模构建人STAT5A(VP1P)三维结构,与RCSB数据库的晶体结构和AlphaFold预测模型进行比对验证。接着采用ZINCPharmer对ZINC数据库进行药效团筛选,对TOP500天然化合物进行AutoDock Vina分子对接。令人振奋的是,鞣花单宁类化合物Pedunculagin以-10.5 kcal/mol的结合能拔得头筹,优于临床II期STAT5抑制剂(-8.5 kcal/mol)。

深入分析显示,前五强化合物(包括叶酸和诃子酸衍生物)均能精准"咬合"SH2结构域保守的Arg638残基——这个如同"分子锁扣"的关键位点。SWISS ADME和ProTox-II评估证实这些天然分子具有良好的类药性和安全性特征。100纳秒分子动力学(MD)模拟中,蛋白-配体复合物展现出"舞蹈般"的稳定动态相互作用,为后续实验研究奠定理论基础。

该研究不仅为靶向STAT5二聚化的抗癌药物开发提供新思路,更彰显了计算机辅助药物设计(CADD)在天然产物活性成分挖掘中的强大潜力。特别是Pedunculagin这类植物多酚化合物,其独特的"分子钳"作用模式,为开发低毒高效的STAT5信号通路抑制剂开辟了新途径。

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