基于逆转录聚合酶链式反应的纳米颗粒表面适配体-蛋白质相互作用检测方法

为解决核酸-蛋白质相互作用对DNA/RNA功能化纳米材料活性和稳定性的影响，研究人员开发了一种结合限制性内切酶与逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)的检测技术。该方法通过设计纳米颗粒(NP)表面可被蛋白结合状态调控的限制酶(RE)特异性序列，实现了RNA适配体与NP表面蛋白质相互作用的精准解析，为生物分析及SELEX筛选提供了模块化研究工具。

　　

核酸与蛋白质的相互作用直接调控着DNA/RNA功能化纳米材料的生物活性和结构稳定性。这项研究创新性地将限制性内切酶(RE)介导的序列切割特性与逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)检测技术相结合，建立了一套用于解析纳米颗粒(NP)表面RNA适配体-蛋白质相互作用的全新方法。

技术核心在于纳米颗粒表面设计的特殊分子开关——当蛋白质与RNA适配体结合时，会特异性掩蔽限制酶识别位点；而游离状态时，该位点则暴露可被酶切。通过RT-PCR定量检测切割后产物的信号强度，即可精确区分特异性结合与非特异性吸附。

这种模块化设计展现出强大的拓展性：既能用于各类RNA-蛋白质相互作用的生物分析研究，又可作为体外筛选压力系统，优化系统进化配体(SELEX)技术流程。该方法为纳米生物界面相互作用研究提供了高灵敏度的分子探针，对功能性纳米材料的理性设计具有重要指导意义。