克罗恩病与缺血性脑卒中共病的共享诊断基因及TLR通路机制:整合生物信息学与机器学习研究

【字体: 时间:2025年07月02日 来源:Mammalian Genome 2.7

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  为解决克罗恩病(CD)与缺血性脑卒中(IS)共病机制不明的难题,研究人员通过整合GEO数据库、WGCNA、机器学习(随机森林/支持向量机)及孟德尔随机化等方法,鉴定出TLR2/TLR8等20个共享基因,揭示TLR通路介导的炎症反应是关键机制,并预测己酸白藜芦醇为潜在治疗药物,为共病精准诊疗提供新靶点(AUC>0.80)。

  

这项研究像侦探般揭开了克罗恩病(CD)与缺血性脑卒中(IS)这对"难兄难弟"的共病谜团。科研团队从基因表达综合数据库(GEO)中获取两组疾病数据,通过差异表达分析和加权基因共表达网络(WGCNA)锁定20个共享基因,发现它们像交通枢纽般集中在Toll样受体(TLR)信号通路这个"热点区域"。

机器学习算法化身"智能筛子",从蛋白互作网络中淘选出TLR2和TLR8两颗"明珠",其诊断效能(AUC>0.80)堪比医学界的"黄金标准"。单细胞RNA测序技术像显微镜般捕捉到这些基因在免疫细胞中的活跃身影,而CIBERSORT分析则量化了免疫细胞的"兵力部署"。更有趣的是,基因变异rs73221365被证实是连接两种疾病的"分子桥梁"。

研究还像药剂师般在DrugBank数据库中筛选出己酸白藜芦醇这个"多面手"化合物,分子对接模拟显示它能稳稳"对接"在TLR蛋白的活性口袋。这些发现不仅为两种疾病的"共同弱点"提供了分子解释,更开辟了"一箭双雕"式精准治疗的新思路。

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