综述：整合多组学方法提升稗子抗逆性

这篇综述系统阐述了稗子（barnyard millet）从野生到驯化的遗传进化历程，强调通过多组学（multiomics）整合NGS（下一代测序）、比较基因组学和基因编辑技术，突破其基因组复杂性限制，实现抗逆（stress resilience）和营养品质协同改良。文章为气候智慧型作物育种提供了创新范式。

　　

Abstract
作为营养丰富且气候适应性强的小杂粮，稗子在应对环境挑战中展现出独特优势。其野生近缘种与栽培种的进化关系揭示了全球种质库（germplasm collections）的遗传价值，而精确解析花器官形态特征为育种家提供了关键表型标记。

基因组研究的挑战与突破
尽管SSR和SNP等分子标记已用于遗传多样性分析，但稗子复杂的基因组结构长期阻碍研究进展。新一代测序（NGS）技术的应用，结合与谷子（foxtail millet）和穇子（finger millet）的比较基因组学分析，实现了跨物种候选基因/QTL的预测。需注意的是，约30%的保守基因座存在功能分化，这要求通过RNA-seq和CRISPR-Cas9编辑进行物种特异性验证。

多组学整合路径
转录组与代谢组联合分析发现，干旱响应中AP2/ERF转录因子家族与脯氨酸合成通路（proB/P5CS）的协同调控具有育种价值。表观组数据则揭示H3K27me3修饰在跨代抗逆记忆中的作用。这种多维度数据交叉验证策略，显著提高了GWAS（全基因组关联分析）的预测精度。

可持续农业前景
当前研究已鉴定出7个与锌/铁生物强化的候选基因（如ZIP家族转运蛋白），以及4个耐盐主效QTL（位于2号和5号染色体）。通过建立稗子泛基因组（pan-genome），未来可进一步挖掘稀有等位基因，为应对气候变化提供新的作物解决方案。