基于靶向二代测序技术(tNGS)提升上呼吸道感染病原体检测效能：qPCR阴性样本的深度探索

来自北京地坛医院和北京海淀医院的研究人员针对qPCR检测阴性的呼吸道样本，采用靶向二代测序技术(tNGS)进行深度分析。研究发现，在206例qPCR阴性样本中，tNGS检出81.1%的病原体（含58种），其中H3N2流感病毒、肺炎链球菌(S. pneumoniae)和金黄色葡萄球菌(S. aureus)最为常见，并首次揭示混合感染与抗生素耐药基因(ARGs)的关联。该研究为呼吸道感染精准诊断提供了重要技术路径。

　　

呼吸道感染病原体常隐匿暴发，快速精准鉴定是靶向治疗的关键。北京两家医院联合开展研究，对2023年11-12月收集的574例咽拭子样本进行检测。定量实时PCR(qPCR)初筛显示35.9%样本（206例）呈阴性，但靶向二代测序(tNGS)技术在这些"假阴性"样本中揪出167例病原体，包括73例H3N2流感病毒、18例肺炎链球菌(S. pneumoniae)和18例金黄色葡萄球菌(S. aureus)。有趣的是，50%混合感染病例存在H3N2与其他病原体"组团作案"，尤以人类β疱疹病毒7型与S. aureus的联合作案最为典型。更值得警惕的是，研究人员在20例样本中捕获到抗生素耐药基因(ARGs)，发现TEM和tetB基因潜伏在鲍曼不动杆菌(A. baumannii)中，而APH基因则藏身于嗜麦芽窄食单胞菌(S. maltophilia)基因组内。这项研究犹如给临床医生配备了"分子显微镜"，证实tNGS在捕捉狡猾病原体方面比qPCR更胜一筹，为呼吸道感染精准诊疗提供了新范式。