基于图卷积网络的多切片共性特征增强全切片图像分类方法研究

【字体: 时间:2025年07月02日 来源:BMC Medical Imaging 2.9

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  本研究针对传统全切片图像(WSI)分类方法忽略组织切片间共性特征的问题,提出了一种基于图卷积网络(GCN)的多切片共性特征融合方法。通过构建跨切片关联图模型,在胃和结直肠癌WSI数据集上实现了91.5%和91.2%的分类准确率,较现有方法提升3-4个百分点,为数字病理诊断提供了更精准的AI解决方案。

  

在数字病理学领域,全切片图像(Whole Slide Image, WSI)已成为癌症诊断的"黄金标准",但其高达吉像素级的分辨率给人工智能分析带来巨大挑战。传统方法将WSI切割成小图块单独处理,犹如盲人摸象般丢失了组织结构的整体信息。更棘手的是,临床实践中病理学家会同时观察同一组织样本的多个连续切片,而现有算法却对这些切片间的潜在关联视而不见。

韩国科学技术院的研究团队在《BMC Medical Imaging》发表的研究中,创新性地将图神经网络与多切片分析相结合。他们发现,就像通过多层CT扫描重建三维结构那样,水平切割的组织切片间存在垂直方向的生物学关联。研究团队开发的跨切片图匹配算法,成功捕捉到这些隐藏的"共性特征",使WSI分类准确率突破性地达到91.5%,为AI辅助病理诊断树立了新标杆。

研究采用三大关键技术:首先通过OpenSlide库将WSI分割为256×256像素的图块,采用监督学习的DenseNet-201提取特征;其次创新性地构建双层图结构,底层表示单切片内图块的空间关系,上层通过匈牙利算法和HEOM度量建立跨切片节点连接;最后采用3层图卷积网络(GCN)进行分类,通过全局平均池化整合特征。

【Slice-level graph generation】
研究将每个切片表示为属性图Gi=(Vi,Ei,Ai),节点代表图块,边连接空间相邻图块。通过质心距离阈值合并离散组织片段,解决了切片形状不规则导致的图断裂问题。

【Commonality matching】
采用异质欧氏重叠度量(HEOM)计算节点特征距离,结合匈牙利算法实现最优匹配。实验显示,添加跨切片边连接的图模型Gˉ比单切片图的分类性能显著提升(p<0.01)。

【WSI classification using GCN】
三层的图卷积网络架构中,每层通过ReLU激活函数提取层级特征。全局平均池化层有效降低了980万参数的计算负担,50%的dropout设置防止了小样本过拟合。

这项研究开创性地将多切片分析引入数字病理领域,其提出的Gˉ图模型首次实现了组织样本的三维信息重建。临床验证表明,该方法对胃癌和结直肠癌的AUROC分别达到98.8%和98.2%,较传统多实例学习(MIL)方法提升2-3个百分点。特别值得注意的是,通过LossDiff算法去除噪声图块后,模型在结直肠癌数据集上的准确率提升12.5%,证实了标签噪声对病理AI的重大影响。

研究的创新点在于模拟了病理医师的工作逻辑——通过多切片比对寻找一致性特征。这种"立体化"的WSI分析方法,为未来开发三维病理诊断系统奠定了基础。尽管当前算法复杂度较高(O(n3)),但团队提出的图种子引导(graph seed guiding)优化方向,为临床应用提供了可行路径。这项成果不仅推进了计算病理学的发展,更为AI辅助癌症早诊提供了新范式。

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