循环肿瘤DNA深度测序作为肝细胞癌经动脉化疗栓塞治疗临床预后的生物标志物研究

本研究针对肝细胞癌（HCC）经动脉化疗栓塞（TACE）治疗后患者生存差异显著的问题，通过靶向测序循环肿瘤DNA（ctDNA）探索其预后预测价值。研究人员对97例患者血浆样本进行18个HCC驱动基因的超深度测序，发现CTNNB1、ARID1A等基因突变与不良总生存期（OS）显著相关，其中TP53突变在多变量分析中仍具独立预后意义（HR=53.3）。该研究为基于肿瘤生物学的TACE疗效分层提供了新思路，相关成果发表于《npj Precision Oncology》。

　　

肝细胞癌（HCC）是全球癌症相关死亡的第三大原因，经动脉化疗栓塞（TACE）作为中期HCC的标准疗法，其疗效却存在巨大异质性——患者生存期可从11个月跨越至45个月。这种"治疗盲盒"现象使得临床决策陷入困境：究竟哪些患者真正受益于TACE？哪些应该直接转向新兴的免疫联合疗法？更棘手的是，HCC的诊断多依赖影像学，仅少数患者能获取肿瘤组织进行分子分析，传统活检难以满足精准医疗需求。

来自英国帝国理工学院NHS信托等机构的Rohini Sharma团队另辟蹊径，将目光投向循环肿瘤DNA（ctDNA）这片"液体活检"的新蓝海。研究者假设：血液中漂浮的肿瘤DNA碎片可能携带决定TACE疗效的关键密码。他们在《npj Precision Oncology》发表的研究中，对97例接受TACE治疗的HCC患者进行了一场分子侦探——通过定制化基因panel捕获18个HCC驱动基因的突变特征，试图破解疗效差异的遗传密码。

研究团队运用三大核心技术：1）采用QIAamp试剂盒从1mL血浆中提取微量ctDNA；2）设计覆盖431个基因组区域的杂交捕获panel（Cell3 Target技术），通过UMI标记实现6000×超深度测序；3）利用GATK和MuTect2算法进行变异检测，严格筛选COSMIC数据库收录的HCC相关突变。样本来自英国（54例）、意大利（27例）和德国（16例）多中心队列，采集时间覆盖TACE前（T0）、治疗后随访（T1）和进展期（T2）。

cfDNA动态变化与临床结局
研究发现TACE后cfDNA水平呈现时间依赖性波动，术后早期显著升高后逐渐回落。但无论是基线水平还是动态变化，均未显示出与治疗反应或生存期的显著关联。这提示单纯的cfDNA定量可能不足以预测TACE疗效。

基线突变图谱的预后价值
在23例成功测序的患者中，基线ctDNA检出CTNNB1（25%）、ARID1A（25%）、SF3B1（20%）和TERT（18%）等高频突变。值得注意的是，变异等位基因频率（VAF）与血清AFP水平显著正相关（Z=-4.1），高VAF患者总生存期缩短3.1倍。突变谱分析显示，CTNNB1（HR=5.3）、TP53（HR=5.3）、ARID1A（HR=5.1）和KEAP1（HR=22.0）突变携带者的死亡风险显著增加。

TP53突变的警示意义
多变量分析中，TP53突变展现出惊人的预后价值——患者死亡风险飙升至53.3倍，与门静脉血栓（HR=26.3）共同构成最强危险信号。尽管该突变仅在1例患者中检出，但其与HCC免疫抑制微环境和巨梁状-大块型（macrotrabecular-massive）亚型的已知关联，为这一发现提供了生物学合理性。

这项研究首次系统描绘了TACE治疗前后ctDNA突变谱的演变规律，证实了液体活检在HCC局部治疗领域的应用潜力。特别重要的是，研究发现TP53等基因突变可能标识出"TACE抵抗群体"，这部分患者或许更适合直接接受免疫联合治疗。但研究也存在明显局限：仅23例样本获得有效测序数据，且TERT等关键基因的检出率低于预期，可能与GC富集区扩增效率低有关。未来需要标准化采样流程（推荐10mL血浆）、扩大样本量，并探索表观遗传学标记与突变谱的协同预测价值。

这项来自国际多中心合作的探索性研究，为HCC精准治疗提供了新的分子路标。当TACE遇上ctDNA，或许不久的将来，医生只需一管血液就能预判栓塞治疗的成败，让患者避免无效治疗的煎熬。正如研究者所言：这项技术最激动人心的应用场景，是帮助临床在TACE与系统治疗之间做出明智抉择。