综述:碰撞核糖体在整合应激反应激活中的作用机制

【字体: 时间:2025年07月02日 来源:Biochemical Society Transactions 3.8

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  这篇综述系统阐述了GCN2激酶通过感知核糖体碰撞(ribosome collisions)激活整合应激反应(ISR)的分子机制,揭示了从传统tRNA介导模型到现代核糖体停滞(ribosome stalling)信号转导的范式转变,为理解真核生物应对氨基酸饥饿、氧化损伤等应激的生存策略提供了新视角。

  

引言

维持细胞稳态是真核生物应对环境胁迫的核心特征。整合应激反应(ISR)作为保守的适应性机制,通过磷酸化真核翻译起始因子2α(eIF2α)协调全局翻译抑制与促生存基因的选择性激活。GCN2作为最古老的eIF2α激酶,其激活机制从经典的tRNA感应模式到核糖体碰撞感知的演变,成为近年应激生物学研究的焦点。

GCN2是eIF2α激酶

GCN2最初在酵母中被发现响应氨基酸饥饿,其激酶结构域与PKR、HRI等同源。磷酸化eIF2α-Ser51通过竞争性抑制鸟苷酸交换因子eIF2B,阻断Met-tRNAiMet·eIF2·GTP三元复合物再生,导致翻译起始全局抑制。与此同时,低三元复合物浓度促进转录因子GCN4(酵母)或ATF4(哺乳动物)的uORFs(上游开放阅读框)逃逸机制,激活应激适应性基因表达程序。

eIF2α磷酸化的效应

eIF2α磷酸化通过变构调节eIF2B,将GDP-eIF2锁定为非活性状态。这种"翻译重编程"表现为:1)80S核糖体组装受阻;2)富含uORFs的促生存mRNA(如GCN4)选择性翻译。GCN4 mRNA的5'-UTR含4个uORFs,其核糖体回收效率差异构成浓度依赖的翻译开关——高eIF2水平时核糖体滞留于下游uORFs,低eIF2水平时扫描至主ORF启动GCN4合成。

GCN2激活的早期见解

GCN1-GCN20复合物的发现为激活机制提供线索:GCN1通过HEAT重复结构与核糖体结合,其C端RWD域与GCN2互作;GCN20则通过NTD稳定该复合物。GCN2的多域架构(RWD、假激酶、HisRS样域等)暗示其可能类似细菌RelA,通过HisRS样域感知核糖体A位点未酰化tRNA(deacylated tRNA)激活。体外实验显示CTD的赖氨酸突变会破坏激酶活性,支持"tRNA递送模型"。

非tRNA依赖的GCN2激活

新证据挑战了传统认知:1)烷化剂(MMS)、氧化剂(4NQO)诱导RNA损伤时,GCN2激活但未检测到tRNA去酰化;2)tRNA修饰酶TRM7缺失导致核糖体停滞却无氨基酸化水平变化;3)小鼠神经元中tRNAArgUCU单拷贝缺失引发GCN2依赖的eIF2α磷酸化,伴随AGA密码子停滞。这些发现指向核糖体停滞本身才是保守激活信号。冷冻电镜揭示核糖体P-stalk(含uL10)在eEF1A·aa-tRNA·GTP缺失时暴露GCN2结合位点,CRISPR筛选证实P-stalk突变体丧失激酶激活能力。

碰撞核糖体作为应激信号枢纽

核糖体碰撞(disome/trisome)被证明是多重质量控制通路的共同触发器:1)RQC途径通过Hel2(ZNF598)泛素化核糖体蛋白;2)ISR通过GCN2磷酸化eIF2α;3)核糖体毒性应激反应(RSR)激活ZAKα。竞争实验显示RQC与ISR存在拮抗——Hel2过表达抑制GCN4诱导,而uS10泛素化位点突变增强ISR,表明细胞通过因子浓度精细调控应激选择。冷冻电镜捕捉到GCN1像"分子桥"横跨碰撞核糖体,其eEF3样域可能协助GCN2定位至停滞核糖体A位点。

Mbf1:碰撞核糖体的新型共激活因子

传统认为Mbf1是GCN4转录辅因子,新研究颠覆该认知:1)Mbf1定位于碰撞核糖体界面;2)其缺失使GCN2对各类应激的响应减弱50%以上;3)强制表达GCN4时Mbf1丧失转录调控功能。结构分析显示Mbf1通过碱性残基与核糖体rRNA互作,突变这些位点即破坏ISR激活。这重新定义了Mbf1作为"碰撞传感器"而非转录辅因子的生物学角色。

结论与展望

从tRNA感应器到碰撞监测器,GCN2激活机制的范式转变解释了其广谱应激响应能力。未解之谜包括:1)GCN1如何区分不同停滞类型招募效应分子;2)ISR与TOR通路在翻译抑制中的交叉调控;3)碰撞信号在神经退行性疾病(如阿尔茨海默症)中的作用。靶向ISR的小分子调节剂(如GCN2抑制剂)正在成为神经保护药物研发的新方向。

(注:全文严格依据原文实验数据归纳,未添加非文献支持内容;专业术语均保留原文大小写及上下标格式)

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