SARS-CoV-2 NiRAN结构域GTP介导的RNA加帽机制争议：基于8GWE模型的重新评估

来自国际研究团队针对SARS-CoV-2 NiRAN结构域在RNA加帽过程中GTP利用机制提出质疑。通过重新分析PDB:8GWE的冷冻电镜数据，发现模型构建存在活性位点错误且无法支持GMPPNP结合结论，推翻了先前关于GTP直接参与加帽的论断，为冠状病毒mRNA合成机制研究提供了关键纠偏。

　　

这篇争议性论文对新冠病毒(SARS-CoV-2)复制转录复合体(RTC)中的关键组件——Nidovirus RdRp相关核苷酸转移酶(NiRAN)结构域提出了颠覆性见解。先前研究声称通过冷冻电镜(cryo-EM)捕获了NiRAN与β-γ不可水解GTP类似物(GMPPNP)及RNA-nsp9的催化中间体(PDB:8GWE)，并据此解析了GTP介导的mRNA加帽机制。

研究团队通过精密的数据重分析发现三个关键问题：

1. 8GWE原子模型存在活性位点构建错误
2. 原始冷冻电镜密度图无法支持GMPPNP配体的建模
3. 提出的催化机制违背基础化学原理

特别值得注意的是，重新处理原始数据后确认，所谓E-RTC:RNA-nsp9:GMPPNP复合体中根本不存在GMPPNP分子。这直接动摇了"GTP直接参与加帽反应"的核心结论，使得冠状病毒通过GDP-多聚核糖核苷酸转移反应实现RNA加帽的分子机制再度成为未解之谜。

这项研究不仅对理解新冠病毒mRNA^5'端帽结构合成具有重要意义，更展示了结构生物学研究中数据解读与模型验证的极端重要性。相关争议的持续探讨或将推动更精确的实验设计来最终揭示NiRAN结构域的真实催化机制。