SARS-CoV-2 NiRAN结构域GTP介导RNA加帽机制的新解析：双底物模型与结构证据

针对SARS-CoV-2 NiRAN结构域GTP介导RNA加帽机制争议，研究人员通过优化冷冻电镜密度数据，结合GTP/GDP/GMPPNP/GDP?BeF3?多底物实验，提出双路径加帽模型，证实GTP水解为GDP是RNA去RNA化(nsp9)的关键步骤，为抗病毒靶点设计提供新视角。

　　

这项研究揭开了新冠病毒(SARS-CoV-2)复制转录复合体中NiRAN结构域的神秘面纱。当病毒需要给RNA"戴帽子"(capping)时，NiRAN像个精明的化学家，既能选用GTP也能选用GDP作为原料。争议焦点在于非水解型GTP类似物GMPPNP能否真正结合G-pocket——通过重新处理原始冷冻电镜数据，研究者获得了比8GWE结构更清晰的电子密度图，像拼乐高一样精准搭建出GMPPNP的分子模型。

有趣的是，NiRAN对GTP的"偏爱"胜过GDP，但这种亲密接触需要RNA化(RNAylated)的nsp9蛋白当"红娘"。实验显示，GTP必须"减肥"成GDP，才能触发RNA-nsp9的分离反应，就像解开分子级别的魔术贴。研究者用GDP?BeF₃^?模拟过渡态，配合生化实验，最终拼出完整拼图：病毒其实备有双料加帽流水线——GTP路线需先水解再干活，而GDP则可直接上岗。这些发现不仅平息了学术争议，更为设计阻断病毒RNA加工的"分子扳手"指明了新靶点。