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综述:真菌生物技术对可持续应用的重要性
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月02日 来源:TRENDS IN Biotechnology 14.3
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这篇综述系统阐述了真菌生物技术如何通过多组学特征、分子修饰和人工智能驱动的设计-构建-测试-学习(DBTL)循环,为可持续发展目标(SDGs)提供创新解决方案。作者重点探讨了工程化曲霉(Aspergillus)和链孢霉(Neurospora)在食品、医药、环境修复等领域的应用潜力,强调其基因组可塑性、次级代谢产物(SMs)多样性及AI驱动的菌株优化对生物经济的关键作用。
真菌生物技术正成为实现联合国可持续发展目标(SDGs)的核心驱动力。通过降解污染物、生产生物燃料和增强作物抗逆性,真菌在环境修复(SDG 6)、清洁能源(SDG 7)和农业可持续性(SDG 2)等领域展现出独特优势。例如,白腐真菌(如Irpex)通过木质素过氧化物酶选择性降解木质素,显著提升生物质转化效率;而丛枝菌根真菌(AMFs)通过分泌β-1,3-葡聚糖酶等防御酶,减少农作物对化学农药的依赖。
真菌的代谢多样性远超细菌,其生物合成基因簇(BGCs)可产生四倍于细菌的次级代谢产物。人工智能通过DBTL循环加速了菌株开发:在设计阶段,梯度提升机(GBM)模型预测最优基因编辑位点;构建阶段采用CRISPR-Cas9和双向启动子(如A. oryzae的ergothioneine通路改造);测试阶段通过高通量筛选验证酶活性(如碱性漆酶产量提升20倍)。

药用真菌(如灵芝、冬虫夏草)富含多糖和萜类化合物,具有免疫调节功能。工程化A. oryzae通过过表达倍半萜合酶,使二萜产量提升20倍;其分泌的碳水化合物活性酶(CAZymes)还能改善面包质地(如木聚糖酶增加体积)和果汁出汁率(果胶酶降低粘度)。在制药领域,漆酶和转氨酶催化氧化反应,用于他汀类药物的绿色合成。
丝状真菌(如Neurospora intermedia)通过纤维素酶降解农业废弃物,而黄孢原毛平革菌(Phanerochaete)的锰过氧化物酶可分解农药(如氯氰菊酯)。真菌菌丝体还能吸附重金属(如Cr6+还原为Cr3+),其固碳潜力相当于全球森林储量的30%。

当前瓶颈包括非模式真菌基因注释不足(仅15%基因功能明确)和共生真菌(如AMFs)基因操作困难。固态发酵(SSF)和整合生物加工(CBP)有望降低生产成本,而卷积神经网络(CNN)将优化真菌群落的空间分布预测。未来需通过全生命周期评估(LCA)验证其碳足迹,推动真菌技术从实验室走向规模化应用。
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