基于高电子迁移率晶体管与RNA夹板连接反应的miRNA超灵敏单核苷酸分辨检测技术

【字体: 时间:2025年07月03日 来源:Biosensors and Bioelectronics 10.7

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  为解决临床癌症生物标志物miRNA检测灵敏度不足和单核苷酸分辨率缺失的难题,研究人员开发了整合RNA夹板连接反应(Splint-Ligation)与AlGaN/GaN高电子迁移率晶体管(HEMT)的SpLig-HEMT生物传感器。该系统在30分钟内实现10-18 M的检测限,动态范围达10-18-10-13 M,并能精准区分单碱基突变,成功应用于卵巢癌患者血清样本分析,为癌症早期诊断提供新工具。

  

在癌症精准医疗领域,微小RNA(microRNA,miRNA)作为调控基因表达的关键分子,其异常表达与肿瘤发生发展密切相关。尽管循环miRNA已被证实是极具潜力的癌症标志物,但临床转化面临两大瓶颈:一是血清中游离miRNA浓度极低(早期患者甚至低于femtomolar级别),二是单核苷酸突变(SNP)可能导致完全不同的调控功能。现有检测方法如qPCR需繁琐的扩增步骤,CRISPR技术受限于原间隔相邻基序(PAM)序列要求,而传统场效应晶体管(FET)传感器因miRNA携带电荷较少导致灵敏度不足。

为解决这些挑战,中国科学院研究人员开发了SpLig-HEMT生物传感系统,创新性地将RNA夹板连接反应与AlGaN/GaN高电子迁移率晶体管(HEMT)相结合。该成果发表于《Biosensors and Bioelectronics》,通过双机制突破技术壁垒:HEMT的二维电子气通道实现信号原位放大,而夹板连接反应通过DNA探针与miRNA的特异性杂交引导连接酶精确连接,形成双重识别架构。关键技术包括:1)构建Au栅极修饰的HEMT传感器阵列;2)设计针对miRNA-21的5'磷酸化DNA探针与3'端修饰探针;3)优化SplintR连接酶反应体系;4)采用30例临床血清样本验证性能。

设计原理
HEMT传感器采用AlGaN/GaN异质结构,其二维电子气通道的量子限域效应显著降低噪声。当miRNA-21与两端DNA探针通过夹板连接形成完整双链时,负电荷密度变化经HEMT放大产生可测电流信号。单碱基错配会阻碍连接酶催化,实现突变分辨。

性能验证
系统对miRNA-21的检测限达1 aM(10-18 M),较传统HEMT灵敏度提升6个数量级。单碱基错配样本无交叉反应,证实单核苷酸分辨率。在血清样本检测中,成功区分健康人与卵巢癌患者(AUC=0.93),且与qPCR结果高度一致。

结论与意义
该研究首次将核酸酶反应与半导体传感技术深度融合,突破现有方法在灵敏度与特异性上的局限。1 aM的检测限使早期癌症筛查成为可能,而无需核酸扩增的检测流程(30分钟完成)大幅提升临床适用性。未来通过调整探针序列可扩展至其他miRNA检测,为癌症分子分型和个体化治疗提供技术支撑。研究获得国家重点研发计划(2022YFA1205804)和广州国家实验室重大项目(GZNL2024A01007)支持。

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