多中心评估Cobas Liat系统即时RT-PCR检测SARS-CoV-2与流感A/B核酸性能:与美国集中化检测的对比研究

【字体: 时间:2025年07月03日 来源:Journal of Clinical Microbiology 6.1

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  这篇研究通过多中心对比验证了Cobas Liat系统的即时RT-PCR(POCT)检测在SARS-CoV-2与流感A/B诊断中的卓越性能。结果显示,其与集中化检测(CTM)的总体符合率(OPA)达98.8%-99.5%,且鼻拭子与鼻咽拭子样本的Ct值高度相关(r=0.83)。该研究为呼吸道症状相似疾病的快速鉴别提供了分子诊断(NAAT)新策略,尤其适用于CLIA豁免场所的非实验室人员操作。

  

ABSTRACT
呼吸道疾病症状相似性凸显了快速精准鉴别病原体的必要性。与传统集中化检测相比,即时分子检测(POCT)能显著缩短结果出具时间。本研究评估了Cobas Liat系统搭载的SARS-CoV-2与流感A/B联合检测试剂(POC RT-PCR)在美国10家医疗机构的临床应用表现。通过复合对照设计(三种集中化检测方法)验证SARS-CoV-2检测性能,单对照验证流感A/B检测。结果显示:鼻拭子样本的总体符合率(OPA)达98.8%(95%CI:97.9-99.3),鼻咽拭子为99.0%(95%CI:98.2-99.4)。值得注意的是,自采鼻拭子病毒载量(Ct值中位数21.1)高于医护采集样本(23.7)。

INTRODUCTION
COVID-19大流行四年后,免疫缺陷人群仍面临重症风险。季节性流行期间,SARS-CoV-2与流感病毒共循环导致鉴别诊断困难。现有抗原POCT灵敏度(71%)显著低于分子POCT(93%),而后者可在20分钟内提供结果。美国传染病学会指南强调流感抗病毒治疗的48小时黄金窗口,这为分子POCT的临床价值提供了理论支撑。

MATERIALS AND METHODS
研究纳入11个中心,其中10家为CLIA豁免机构,操作人员(n=30)模拟真实场景下的非实验室人员。前瞻性样本采集采用配对设计:每位受试者同时采集鼻拭子(自采/医护采集)和鼻咽拭子。SARS-CoV-2检测采用三合一复合对照(Cobas 6800/8800系统双试剂+Hologic Aptima试剂),流感检测以Cobas 6800/8800为金标准。

RESULTS
在2,247例样本中,SARS-CoV-2检测的假阳性多集中于高Ct值范围(中位数35.2)。Deming回归显示鼻拭子与鼻咽拭子Ct值高度线性相关(r=0.83),其中医护采集样本相关性更高(r=0.91 vs 自采0.77)。流感A/B检测OPA均≥99.5%,但部分流感A假阳性样本Ct值达39.9(接近检测限)。操作便捷性问卷显示平均评分4.5/5分,证实该系统适合非专业人员使用。

DISCUSSION
本研究首次系统评估了采样方式(自采/医护)、疫苗接种状态等因素对检测性能的影响。与既往认知不同,鼻拭子(尤其自采样本)表现出更高的病毒载量。尽管存在约1%的临界值样本判读差异,但双靶标设计(ORF1a/b和N基因)通过生物信息学验证可覆盖99.99%的变异株。局限性在于部分流感样本来自2013-2014年流行季,可能无法完全代表当前流行株特征。

Conclusion
Cobas Liat系统实现了实验室级精度与床旁检测速度的结合。其多重检测能力对SARS-CoV-2与流感共感染(可增加6.3倍重症风险)的早期识别具有重要临床价值,为分级诊疗体系下的呼吸道传染病管理提供了新范式。

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