坦桑尼亚临床分离弗氏柠檬酸杆菌基因组特征及多重耐药机制研究

来自坦桑尼亚的研究人员对弗氏柠檬酸杆菌(Citrobacter freundii)临床分离株进行基因组测序分析，揭示了ST167型菌株携带blaCTX-M-15、qnrB等耐药基因及毒力因子，为资源有限地区的感染防控提供了重要分子流行病学依据。

　　

在坦桑尼亚布甘多医学中心的骨科病房，一群特殊的细菌战士正引发警报——弗氏柠檬酸杆菌(C. freundii)通过获得性耐药基因武装自己，成为医院感染的潜在威胁。研究人员采用宏基因组学"侦探工具包"：通过选择性培养筛选ESBL(超广谱β-内酰胺酶)阳性菌株，运用NovaSeq 6000平台进行150bp双端测序，再借助SPAdes算法像拼图般组装出5.1-10.2Mb不等的基因组草图。

最引人注目的当属ST167型菌株，这个"超级战士"携带bla_CTX-M-15、bla_TEM-1等耐药基因组成的"武器库"，配合espX1等毒力因子形成攻防体系。生物信息学分析显示，其基因组中潜伏着IncHI1B等质粒复制子，像特洛伊木马般传播耐药性。而ST263型菌株则展现出不同的生存策略，仅携带qnrB等有限耐药基因。

通过Proksee绘制的基因组环形图谱生动呈现了这些特征：紫色编码序列(CDS)如星群密布，橙色tRNA标记点缀其间，而绿色AMR(抗菌素耐药)基因簇则像危险信号灯般醒目。这些发现为理解细菌在抗生素压力下的进化博弈提供了新视角，尤其对撒哈拉以南非洲地区的感染控制具有重要启示。