泰国2023年手足口病病原体柯萨奇病毒A16基因型B1c近全基因组解析及其流行病学意义

来自泰国玛希隆大学的研究人员对一例手足口病(HFMD)患儿的粪便样本进行病毒分离，采用纳米孔测序技术获得柯萨奇病毒A16(CVA16)基因型B1c毒株AI005的近全基因组序列(7,350 nt)。该毒株与印度2022年流行株(OR437338.1)基因组相似度达98%，系泰国首次报道的B1c亚型，为东南亚地区肠道病毒分子流行病学研究提供了重要数据。

　　

在热带医学前沿阵地泰国，科学家们捕获了一个值得关注的病毒"新移民"——从2023年8月一名曼谷男童手足口病(HFMD)患者的粪便中，成功分离出柯萨奇病毒A16(CVA16)基因型B1c毒株AI005。这个直径仅30纳米的微小敌人，其RNA基因组如同精密设计的"恶意代码"，包含7,350个核苷酸，其中5'非编码区(UTR)716个碱基像"启动密码"，后面紧跟着6,582个碱基的开放阅读框(ORF)，最终以51个碱基的3'UTR收尾。

研究团队运用牛津纳米孔公司的MinION测序仪，配合新型R10.4.1流动槽，就像在微观世界架设了高清监控摄像头，获得N₅₀达697的高质量数据。基因组拼图显示，这个病毒"刺客"与印度2022年流行株有着98%的基因相似度，在系统进化树上与中印毒株聚集成B1c分支，就像发现了病毒界的"跨国犯罪团伙"。

特别值得注意的是，虽然P1-P3蛋白前体的基因结构与经典CVA16一致，但这是泰国首次揪住B1c亚型的"狐狸尾巴"。这个发现如同在病毒流行病学地图上插下新坐标，提示我们需要警惕肠道病毒(Enterovirus)通过国际旅行进行的"秘密渗透"。玛希隆大学的病毒猎人们将继续追踪：这个毒株究竟是"空降兵"还是本土演化的"伪装者"？答案或许藏在后续的分子钟分析中。