鞘氨醇杆菌(Sphingobacterium sp.)多酶协同系统强化青霉素G降解的分子机制:通路解析、蛋白质组学与结合动力学研究

【字体: 时间:2025年07月03日 来源:International Journal of Biological Macromolecules 7.7

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  为解决青霉素G钠(PGNa)在制药发酵残留物中的持久性污染问题,研究人员针对Sphingobacterium sp. SQW1菌株的多酶系统开展分子机制研究。通过诱导优化使酶活性提升13倍,鉴定出关键酶AmpC,并解析β-内酰胺环水解等三条降解途径。该研究首次在分子水平阐明细菌酶复合体降解PGNa的机制,为β-内酰胺类抗生素残留的生物修复提供新范式。

  

青霉素作为人类历史上首个发现的抗生素,至今仍是抗击细菌感染的重要武器。然而鲜为人知的是,全球每年有超过15,000吨青霉素盐类生产过程中,约300,000吨含高浓度青霉素G钠(PGNa)的发酵残留物被排放到环境中。这些残留物中PGNa浓度高达898-1099 mg/kg,通过水体扩散后不仅破坏生态平衡,更可怕的是会加速抗生素耐药基因(ARGs)的传播——这些基因能通过质粒和转座子在微生物间"跳跃"传递,被世界卫生组织列为21世纪最严峻的公共卫生威胁之一。

面对这一棘手难题,传统处理方法存在效率低、二次污染等问题。上海某研究团队另辟蹊径,将目光投向了一种特殊的土壤细菌——鞘氨醇杆菌(Sphingobacterium sp.) SQW1。这种从青霉素发酵废料堆周边分离的菌株,展现出惊人的PGNa降解能力。研究人员突破性地发现,用碳青霉烯类抗生素美罗培南(meropenem)诱导后,其降解酶活性暴增13倍,仅50分钟就能清除83.82%的2000 mg/L PGNa污染。

为揭示背后的分子奥秘,团队运用了多组学联用策略:通过比较蛋白质组学从43个差异表达蛋白中锁定关键酶AmpC(一种β-内酰胺酶);结合分子对接技术证实其对PGNa的强结合亲和力;利用液相色谱-质谱联用技术(LC-MS)完整绘制出三条降解途径。特别值得注意的是,除经典的β-内酰胺环水解和青霉素酰化酶(Penp)介导的侧链切割外,还首次发现氧化脱羧/去甲基化新途径,这为理解抗生素完全矿化机制提供了全新视角。

在技术方法上,研究团队首先优化培养基成分,确定半乳糖(GAL)为最佳碳源;继而通过酶动力学分析证实降解系统在55℃和pH 7.0时活性最高(1585.32 U/mL);最后整合分子对接与分子动力学模拟,阐明AmpC与PGNA的相互作用模式。所有实验均采用HPLC定量检测降解效率。

研究结果部分:

  1. 培养基组分优化:半乳糖作为碳源时酶活性达193.25 U/mL,显著高于葡萄糖(GLC)及其混合体系。
  2. 酶特性表征:降解酶在55℃展现峰值活性,且对多种β-内酰胺类抗生素(如头孢噻肟、氨苄西林)具有广谱降解能力。
  3. 蛋白质组学分析:DacC(β-内酰胺酶)、Penp(青霉素酰化酶)和Ysh1(去甲基酶)表达量上调32倍。
  4. 降解途径解析:LC-MS鉴定出苯乙酸、青霉噻唑酸等中间产物,证实降解过程无有毒副产物积累。

这项发表于《International Journal of Biological Macromolecules》的研究,首次在原子尺度揭示了细菌酶系协同降解PGNa的"流水线作业"机制。其重要意义不仅在于开发出比传统方法快15倍的生物修复技术,更重要的是建立了"酶诱导-靶标鉴定-途径解析"的研究范式,为其他抗生素残留治理提供模板。正如研究者所言:"当人类与耐药菌的军备竞赛陷入僵局时,向自然界的微生物‘老师’取经,或许是我们最明智的选择。"

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