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α-2′-脱氧鸟苷通过定向G-四链体组装构建高稳定性反平行结构及其治疗潜力研究
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月03日 来源:International Journal of Biological Macromolecules 7.7
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本研究针对G-四链体(GQ)结构多样性调控难题,通过引入α-2′-脱氧鸟苷(αdG)模拟天然syn构型脱氧鸟苷,设计出具有同极性G-四联体的反平行三链层GQ结构。研究人员采用圆二色谱(CD)和引物延伸阻断实验证实,αdG修饰显著提升GQ热稳定性,并实现靶向诱导GQ形成以阻断DNA合成。该成果为开发基于GQ结构的基因治疗策略提供新思路,发表于《International Journal of Biological Macromolecules》。
在生命科学领域,DNA和RNA中非经典的G-四链体(G-quadruplex, GQ)结构因其在转录调控、端粒维持等关键生物学过程中的作用而备受关注。这类由鸟嘌呤碱基通过Hoogsteen氢键形成的四链结构,其拓扑构型和稳定性高度依赖糖苷键的syn-anti构象异构。然而,天然GQ结构的动态性和构象多样性给靶向干预带来巨大挑战——如何精确控制GQ折叠模式并提升其稳定性,成为开发相关疗法的核心瓶颈。
针对这一难题,来自俄罗斯的研究团队Irina V. Varizhuk等创新性地利用α-2′-脱氧鸟苷(αdG)的独特性质开展研究。这种核苷酸类似物因糖环构型反转,其糖苷键始终维持anti构象,却能在空间排布上完美模拟天然syn构型脱氧鸟苷。研究者设想:将αdG引入GQ核心替代天然syn-dG,既可锁定G-四联体构象,又能通过减少构象重排提升整体稳定性。相关成果发表在《International Journal of Biological Macromolecules》,为定向设计功能性核酸结构开辟新路径。
研究团队主要运用三项关键技术:圆二色谱(CD)分析确认GQ拓扑构型,紫外熔解实验测定热稳定性,以及模板指导的引物延伸阻断实验(PEX)验证生物功能。其中PEX实验采用102nt长DNA模板,通过设计包含"引导序列+G-钳"的合成构件,在特定G3位点诱导αdG修饰GQ形成。
设计修饰GQ模型
基于前期抗凝血GQ研究,团队选择含TT/TGT侧环的反平行三链层结构为原型。通过全αdG替换syn-dG位点,构建出所有G-四联体极性一致的创新结构(图2)。分子建模显示,αdG的anti构象使其核糖环与相邻磷酸骨架形成额外氢键,这是稳定性提升的结构基础。
生物物理表征
CD谱在265nm/295nm出现特征峰,证实反平行拓扑。熔解实验显示修饰GQ熔点(Tm)提升超15°C,且阳离子依赖性显著降低。值得注意的是,全αdG修饰结构在钾/钠离子中均保持稳定,而天然GQ在钠离子中易解离。
治疗潜力验证
PEX实验表明,含αdG的G-富集寡核苷酸可精确引导GQ在模板链G3位点形成,使DNA聚合酶延伸效率下降90%。这种位点特异性阻断效果,为开发基因表达调控工具提供新策略。
该研究首次实现全同极性反平行GQ的理性设计,揭示αdG通过"构象锁定"和"额外氢键"双重机制增强稳定性的分子基础。相较于传统化学修饰,这种仿生策略更接近天然核酸的理化特性,在凝血调控、基因沉默等治疗领域具有独特优势。作者特别指出,αdG修饰GQ对钠离子的强耐受性,可能解决体内应用的环境适应性问题。未来研究将聚焦于这类结构在染色质环境中的行为,以及开发针对特定基因的靶向调控系统。
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