非酒精性脂肪性肝炎与克罗恩病共同病因及枢纽生物标志物(GLUL)的鉴定与验证

【字体: 时间:2025年07月03日 来源:Digestive Diseases and Sciences 2.5

编辑推荐:

  为解决非酒精性脂肪性肝炎(NASH)与克罗恩病(CD)的共病机制问题,研究人员通过整合GSE186582(CD)和GSE164760(NASH)数据集,利用edgeR/limma筛选差异基因(DEGs),结合KEGG和PPI网络分析,鉴定出104个共同DEGs及GLUL等10个枢纽基因。ROC曲线证实GLUL(AUC>0.8)的诊断价值,并发现转录因子SRF/YY1的调控作用,为两种疾病的共性病理机制提供新靶点。

  

这项研究深入探索了非酒精性脂肪性肝炎(Non-alcoholic steatohepatitis, NASH)和克罗恩病(Crohn's disease, CD)之间隐藏的分子关联。通过挖掘基因表达综合数据库(GEO)中GSE186582(CD)和GSE164760(NASH)两组RNA测序数据,团队运用edgeR和limma包精准捕获到104个共同差异表达基因(Differentially Expressed Genes, DEGs),其中62个下调、42个上调。

基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析揭示,两种疾病均存在显著的氨基酸代谢重编程。研究人员通过STRING数据库构建蛋白质相互作用(Protein-Protein Interaction, PPI)网络,并借助Cytoscape平台的cytoHubba插件锁定10个核心枢纽基因——包括谷氨酰胺合成酶(GLUL)、III型胶原(COL3A1)、胱硫醚酶(CTH)等。特别值得注意的是,受试者工作特征(ROC)曲线显示GLUL的诊断效能突出,曲线下面积(AUC)双双突破0.8大关,这一发现在独立数据集GSE20881(CD)和GSE63067(NASH)以及RT-qPCR实验中均得到验证。

更令人振奋的是,基于枢纽基因预测的转录因子血清反应因子(SRF)和YY1转录因子(YY1)在两种疾病中均呈现显著表达差异。这些发现如同拼图的关键碎片,将NASH和CD这两种看似不相关的疾病通过GLUL为核心的分子网络紧密联结,为开发跨病种诊疗策略开辟了新视角。

相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博
  • 急聘职位
  • 高薪职位

知名企业招聘

热点排行

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号