基于新型紫苏SSR标记的栽培品种遗传变异分析及其育种应用价值

为解决东亚地区紫苏(P. frutescens)种质资源遗传标记匮乏问题，研究人员通过RNA测序开发600对SSR引物，筛选出173对(28.8%)具多态性标记，成功应用于25个韩日栽培品种的遗传多样性分析。研究发现PF与PC变种间存在显著遗传分化(GD均值0.373 vs 0.383)，为紫苏分子育种提供重要工具。

　　

在东亚美食文化中备受推崇的紫苏(Perilla)，不仅是重要的油料作物，更是日韩料理中不可或缺的叶用蔬菜。为突破紫苏遗传育种研究的分子标记瓶颈，研究者另辟蹊径采用RNA测序技术，成功构建包含600对简单序列重复(SSR)引物的分子标记库。经过四份紫苏种质的初步筛选，这些引物展现出丰富的多态性特征——28.8%的引物能产生多态性条带，如同遗传密码的"条形码"般清晰可辨。

精选70对核心引物对25份韩日栽培品种进行深度解码，共捕获223个等位基因，平均每个位点蕴含3.2个遗传变异。基因多样性(GD)数值在0.077至0.842间跃动，整体均值达0.494，揭示出紫苏种质库蕴藏的丰富遗传潜力。特别有趣的是，紫苏的两个重要变种——油用型P. frutescens var. frutescens(PF)和叶用型P. frutescens var. crispa(PC)展现出泾渭分明的遗传结构(GD均值分别为0.373和0.383)，仅有个别品种出现"跨界"现象。这些新开发的SSR标记犹如遗传放大镜，为解析紫苏品种间的亲缘关系、指导精准育种提供了分子水平的"导航仪"。