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墨西哥索诺拉濒危野生棉花Gossypium turneri的遗传多样性保护:旅游开发威胁下的物种生存策略
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月03日 来源:Conservation Genetics 2.0
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本研究针对墨西哥索诺拉州特有濒危野生棉花Gossypium turneri,通过基因分型测序(GBS)技术解析其遗传多样性与种群结构,揭示旅游驱动型沿海开发对该物种的生存威胁。研究发现三个遗传分化群体,其中南部种群具有最高私有等位基因,建议通过种子收集(ex-situ)和限制沿海开发(in-situ)等差异化保护策略维护其遗传资源。成果为濒危作物野生近缘种(CWR)保护提供科学范式。
在墨西哥阳光灿烂的索诺拉海岸,一种名为Gossypium turneri的野生棉花正面临生存危机。这种开白色花朵的灌木是棉花栽培品种的重要野生近缘种,却因旅游区酒店和码头的扩张,栖息地被不断压缩。更令人担忧的是,作为《世界自然保护联盟红色名录》认定的极危物种,其遗传资源尚未得到系统评估——而这正是物种能否适应气候变化和病害的关键。墨西哥国立自治大学生态研究所与索诺拉大学的研究团队在《Conservation Genetics》发表论文,首次揭示了该物种的遗传密码,为抢救性保护提供科学依据。
研究采用基因分型测序(GBS)技术对89个样本进行全基因组SNP检测,通过ADMIXTURE和PCA分析种群结构,结合AMOVA和FST计算遗传分化程度,并利用DIYABC模拟种群历史。样本来自圣卡洛斯北部三个地理隔离群体:El Mirador、La Manga和Roca El Choyudo,覆盖该物种62-883株成体的分布范围。
遗传分化
个体祖先成分分析(K=3)与主成分分析(PCA)均证实存在三个遗传簇,对应采样地理群体。AMOVA显示群体间变异占8.84%(p=0.0009),全局FST=0.088呈现中度分化。其中El Mirador与另两个群体的FST值最高(0.099-0.103),而相距2.2 km的La Manga与Roca El Choyudo分化较弱(FST=0.061)。曼特尔检验证实距离隔离效应(r=0.791)。
遗传多样性
全样本检测到2,000个有效等位基因,群体水平Ho(0.244-0.256)显著高于He(0.231-0.238)。El Mirador拥有17,303个私有等位基因,远超其他群体(5,429-9,910),其核苷酸多样性(π=0.243)也最高。近交系数FIS接近零,印证其花柱异长特征促进的异交机制。
种群脆弱性
有效种群大小Ne仅为18-32,远低于防止近交的阈值50。其中La Manga群体因居民区扩张,仅存62株成体。ABC分析显示所有群体均经历近期瓶颈,El Mirador作为祖先群体最早分化。
研究建议采取分级保护:对受开发威胁的El Mirador建立微型保护区,其15株个体的种子即可保留95%遗传多样性;在城市化严重的La Manga推广园艺栽培;对相对完整的Roca El Choyudo则建议恢复1937年设立的"魔鬼峡谷"保护区。该工作不仅为濒危CWR保护建立技术范式,更警示旅游开发需平衡生态红线——毕竟每一株野生棉花都可能蕴藏着对抗未来病虫害的基因密钥。


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