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马达加斯加指猴(Daubentonia madagascariensis)适应度效应分布研究:整合群体历史与突变重组率异质性的进化基因组学解析
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月03日 来源:American Journal of Primatology 1.8
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来自国际研究团队的最新成果揭示了濒危物种指猴的适应度效应分布(DFE)。通过整合高质量参考基因组、群体历史模型及突变/重组率数据,研究发现该物种较人类具有更高比例的有害突变,印证了其更大的长期有效群体规模,同时鉴定出免疫相关基因和感官相关基因的快速进化特征。这项研究为理解灵长类亚目Strepsirrhini的进化动力学提供了关键数据。
这项开创性研究首次系统描绘了濒危物种指猴(Daubentonia madagascariensis)的适应度效应分布(Distribution of Fitness Effects, DFE)。作为灵长类Strepsirrhini亚目中独特的单型科物种,指猴的进化特征长期缺乏基因组尺度解析。研究团队巧妙整合三大关键要素:新发布的高质量注释基因组、可靠的群体历史模型,以及直接/间接估算的突变率与重组率参数。
分析揭示该物种DFE呈现显著特征:相较于人类,指猴基因组携带更高比例的有害突变,这一发现有力支持了其历史上更大的长期有效群体规模(Ne)假说。但更引人注目的是,研究通过功能注释锁定两类加速进化基因——免疫相关基因(可能与病原体军备竞赛有关)和感官相关基因(可能适应特殊生态位),为理解该夜行性物种的特殊适应性提供了分子证据。
鉴于马达加斯加持续森林砍伐导致的生存危机,这项研究不仅填补了灵长类进化研究的空白,更建立了评估指猴长期进化潜力的定量框架。特别是对Daubentoniidae这个孑遗科物种的选择压力分析,为濒危物种保护遗传学提供了范式转移级的研究案例。
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