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长链非编码RNA RYR3-DT通过CoQ10/FSP1轴调控铁死亡影响胶质瘤进展的DNA异常高甲基化机制
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月04日 来源:Discover Oncology 2.8
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本研究针对胶质瘤治疗中分子机制不清、预后差的问题,通过表观遗传学和功能实验揭示了lncRNA RYR3-DT通过DNA高甲基化调控CoQ10/FSP1通路促进铁死亡(ferroptosis)的关键作用。研究人员发现RYR3-DT沉默可抑制胶质瘤细胞增殖、迁移并诱导凋亡,为靶向铁死亡的新型治疗策略提供了理论依据。
胶质瘤作为中枢神经系统最具侵袭性的恶性肿瘤,尽管近年来放疗、化疗和免疫治疗取得进展,但其高复发率和分子异质性仍是临床治疗的重大挑战。传统治疗手段难以突破肿瘤微环境的复杂性,亟需探索新的分子靶点和调控机制。在这一背景下,铁死亡(ferroptosis)——一种由脂质活性氧(ROS)积累引发的程序性细胞死亡方式,因其在肿瘤清除中的潜在作用成为研究热点。与此同时,表观遗传学修饰尤其是DNA甲基化被证实与胶质瘤发生发展密切相关,而长链非编码RNA(lncRNA)作为基因表达的关键调控因子,其在胶质瘤中的功能网络仍有大量未知领域。
河北燕达医院神经外科的研究团队在《Discover Oncology》发表的研究,首次揭示了lncRNA RYR3-DT通过DNA异常高甲基化调控CoQ10/FSP1通路影响胶质瘤铁死亡的具体机制。研究发现RYR3-DT在胶质瘤组织和细胞系中显著高表达,且其表达水平与WHO分级呈正相关。通过5-氮杂-2'-脱氧胞苷(5-Aza-dC)去甲基化处理证实,RYR3-DT的表达受启动子区CpG岛甲基化状态直接调控。
研究采用多种关键技术:从天津环湖医院获取的10例胶质瘤组织样本和8例正常脑组织进行甲基化特异性PCR(MSP)和亚硫酸氢盐测序(BGS);通过siRNA转染在LN229和U87细胞系中实现RYR3-DT基因沉默;采用CCK-8、Transwell和流式细胞术评估细胞表型;RNA测序分析差异表达基因;裸鼠异种移植模型验证体内效果。
3.1 RYR3-DT在胶质瘤组织和细胞系中表达升高
qRT-PCR检测显示RYR3-DT在胶质瘤组织中的表达显著高于正常脑组织(图1A),且与肿瘤恶性程度正相关。在六种胶质瘤细胞系中,U87细胞表达量最高而LN229最低(图1B),后续实验选择这两种细胞进行功能验证。
3.2 5-Aza-dC处理上调U87细胞中RYR3-DT表达
生物信息学预测发现RYR3-DT启动子和内含子区富含CpG岛(图2A)。BGS分析显示LN229和U87细胞中RYR3-DT存在不同程度的甲基化(图2B)。经DNA甲基转移酶抑制剂5-Aza-dC处理后,RYR3-DT表达显著回升(图2C),MSP证实启动子区异常高甲基化是其表达抑制的关键机制(图2D)。
3.3 RYR3-DT敲低抑制胶质瘤细胞增殖并促进凋亡
选择沉默效率最佳的si-RYR3-DT-ii和si-RYR3-DT-iii进行后续实验(图3A)。CCK-8检测显示RYR3-DT沉默显著抑制细胞增殖(图3B),伤口愈合实验显示迁移能力下降(图3C),克隆形成和Transwell实验进一步验证其对恶性表型的抑制作用(图3D-E)。Annexin V检测显示凋亡率显著增加(图3F-G)。
3.5 RYR3-DT敲低通过CoQ10/FSP1通路促进铁死亡
RNA-seq分析发现228个差异表达基因(图4A-C),其中铁死亡相关通路显著富集。Western blot证实RYR3-DT沉默导致FSP1和CoQ10蛋白水平降低(图4E)。FerroOrange检测显示细胞内Fe2+水平升高(图5A-B),C11 BODIPY581/591探针显示脂质过氧化增强(图5C-D),JC-1染色显示线粒体膜电位下降(图5E-F),这些均是铁死亡的典型特征。
3.7 裸鼠模型中RYR3-DT敲低抑制肿瘤生长
体内实验显示sh-RYR3-DT组肿瘤体积和重量显著减小(图6B-D),免疫组化显示Ki67和FSP1表达下调(图6E),证实RYR3-DT通过调控FSP1影响肿瘤进展。
该研究首次阐明RYR3-DT作为DNA高甲基化调控的lncRNA,通过CoQ10/FSP1轴影响铁死亡进程的分子机制。讨论部分指出,虽然发现PRNP基因在qPCR和RNA-seq结果中存在差异(可能源于技术方法差异),但RYR3-DT调控铁死亡的核心结论经多平台验证可靠。研究局限性在于尚未通过回补实验完全确立因果关系,未来需通过RYR3-DT过表达联合FSP1抑制等策略进一步验证。这一发现不仅为胶质瘤提供了新的预后标志物,更开辟了通过表观遗传调控铁死亡通路的新型治疗方向,具有重要的临床转化价值。
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