香豆素类化合物抗阿尔茨海默病的计算机模拟研究:多靶点抑制机制与药物设计新策略

【字体: 时间:2025年07月04日 来源:Results in Chemistry 2.5

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  为解决阿尔茨海默病(AD)缺乏有效治疗药物的难题,研究人员通过计算机模拟技术(in silico)筛选了8种香豆素衍生物对乙酰胆碱酯酶(AChE)的抑制作用。研究发现,4种化合物(Cou2/5/6/8)的分子对接得分(-11.60至-12.07 kcal/mol)优于一线药物多奈哌齐(DPZ),分子动力学模拟证实其能稳定结合AChE的催化位点(CAS)和外围位点(PAS)。该研究为开发兼具抗AChE活性和抗炎作用的AD新药提供了理论依据。

  

阿尔茨海默病(AD)作为最常见的老年痴呆症类型,目前全球患者已超过5000万,但自2003年以来尚无突破性治疗药物问世。现有的一线药物如多奈哌齐(DPZ)虽能通过抑制乙酰胆碱酯酶(AChE)缓解症状,但存在胆碱能过度刺激、无法阻止β-淀粉样蛋白(Aβ)沉积等局限性。更棘手的是,AD的发病机制涉及胆碱能系统衰退、氧化应激和神经炎症等多重因素,亟需开发能同时靶向多个病理环节的新型药物。

在此背景下,研究人员将目光投向了天然产物香豆素。这类具有苯并吡喃酮骨架的化合物不仅合成灵活,还具有抗氧化、抗炎和抗AChE等多重活性。特别是7-羟基香豆素衍生物,已有研究显示其能穿透血脑屏障并抑制AChE,但具体作用机制和构效关系尚不明确。

为系统评估香豆素类化合物的抗AD潜力,研究人员采用计算机辅助药物设计(CADD)技术,对6种合成衍生物和2种天然香豆素(分离自Psoralea arizonica)进行了多维度分析。研究首先通过分子对接筛选出与AChE结合能优于DPZ的候选分子,再结合20 ns分子动力学模拟验证复合物稳定性,最后通过ADMET预测评估成药性。

关键技术方法包括:1)基于密度泛函理论(DFT)的化合物结构优化;2)使用Autodock Vina对AChE(PDB ID:1EVE)进行分子对接,验证方法RMSD为0.77±0.06 ?;3)采用OPLS_2005力场进行20 ns分子动力学模拟;4)通过Molinspiration和PASSonline预测生物活性;5)利用SwissADME和pkCSM评估理化性质与药代动力学参数。

3.1 分子对接验证与方法学
重新对接实验证实,DPZ与AChE晶体结构的RMSD为0.83 ?,验证了方法的可靠性。所有香豆素衍生物均能同时结合AChE的催化位点(CAS,含Trp84/Phe330)和外围位点(PAS,含Tyr121/Trp279),其中Cou8对接得分最低(-12.07 kcal/mol),提示其可能成为双位点抑制剂。

3.2 分子动力学模拟分析
20 ns模拟显示,所有复合物的蛋白骨架RMSD波动<2.0 ?,半径

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