US-align：跨分子类型快速精准比对的蛋白质与核酸结构多重对齐算法

来自密歇根大学的研究人员开发了开源工具US-align，通过动态编程和TM-score优化算法，实现了蛋白质、RNA、DNA的单体/多聚体结构快速比对（1秒内完成），支持跨分子类型比较，为异源分子结构预测和功能注释提供了关键技术支持。

　　

随着结构生物学蓬勃发展及深度学习预测技术的突破，大分子结构的快速精准比对成为结构生物信息学核心挑战。US-align应运而生——这款开源工具采用迭代叠加与动态编程(dynamic programming)相结合的核心算法，搭载统一且与序列长度无关的TM-score评分体系，可高效完成蛋白质、RNA、DNA的序列依赖/非依赖型比对，同时兼容单体结构和多聚体复合物分析。其独特设计不仅使比对精度和速度超越同类工具，更成为首个支持跨分子类型比对（如蛋白质-RNA）的通用方案，这对基于模板的异源分子结构预测及功能注释至关重要。用户可通过命令行、在线服务器或PyMOL插件调用，安装仅需数分钟，典型比对任务可在1秒内完成。