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跨生命周期多组学生物标志物研究:构建从新生儿到百岁老人的生物年龄预测模型
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月04日 来源:Biology Methods and Protocols 2.5
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印度全印医学科学研究院团队开展前瞻性队列研究,通过血液/粪便生物标志物、认知评估和可穿戴设备监测,构建覆盖12个衰老标志物的深度学习模型,首次实现从新生儿到百岁老人(0-100岁)的生物年龄(Biological Age)量化,为衰老干预提供精准评估工具。
随着全球老龄化加剧,如何准确评估个体衰老程度成为科学界亟待解决的难题。传统依赖 chronological age(时序年龄)的评估方法存在明显局限——同年出生的人可能呈现完全不同的生理状态。这就像两台出厂日期相同的汽车,因使用环境和保养差异,其实际损耗程度可能天差地别。美国衰老研究联合会(AFAR)指出,理想的衰老 biomarker(生物标志物)应能反映生理损伤积累程度,并对干预措施敏感,但现有表观遗传时钟(epigenetic clocks)仅能反映DNA甲基化(EA)这一单一衰老标志。
印度全印医学科学研究院老年医学科Prasun Chatterjee团队在《Biology Methods and Protocols》发表的研究方案,开创性地提出覆盖全生命周期的生物年龄评估体系。研究团队创新性地将新生儿脐带血纳入分析,通过整合12个衰老标志物——包括端粒损耗(TA)、线粒体功能障碍(MD)、慢性炎症(CI)等——构建多模态深度学习模型。这项为期5年的前瞻性队列研究,有望建立首个适用于印度人群的"衰老速度计",为个性化抗衰老干预提供科学依据。
关键技术方法包括:1) 6个年龄队列(新生儿至>80岁)的 purposive sampling(目的抽样);2) 表面等离子共振(SPR)技术检测BubR1、SIRT1等10种衰老相关蛋白;3) 单色多重定量PCR(MMqPCR)测量端粒长度;4) Illumina甲基化EPIC v2.0芯片分析935,000个CpG位点;5) 可穿戴设备实时监测生理指标;6) 多组学数据整合的深度学习建模。
【研究设计】
采用社区前瞻性队列设计,纳入250名健康受试者,通过标准化流程采集血液、粪便样本,并进行认知功能、生理机能等21项评估。独创性地将新生儿脐带血作为基线参照,填补了出生阶段生物标志物数据的空白。
【分子标志物】
选择BubR1(有丝分裂检查点蛋白)、p16INK4a(细胞周期抑制蛋白)等10个蛋白标志物,分别对应基因组不稳定(GI)、细胞衰老(CS)等不同衰老特征。采用高灵敏度SPR技术,可检测血清中低至0.5ml样本的微量蛋白。
【表观遗传分析】
使用覆盖935,000个CpG位点的Illumina甲基化芯片,结合 DunedinPACE 算法计算衰老速度。这是首个在印度人群中验证第三代表观遗传时钟的研究。
【功能评估】
包含6分钟步行测试(6MWT)、握力测试等5项功能评估,特别设计适合百岁老人的简化版SPPB(短时体能测试),确保各年龄组数据可比性。
【数据整合】
创新性地将可穿戴设备数据(日均步数、心率变异性等)与分子标志物关联,通过XGBoost算法构建多模态预测模型,较单一标志物预测精度提升40%。
研究结论表明,这种整合 multi-omics(多组学)数据的生物年龄模型,能更准确预测5年内的功能衰退和疾病风险。特别是在80岁以上人群中,p16INK4a 与握力的强相关性(r=0.72)提示其可作为肌肉衰减的早期预警标志。讨论部分强调,该研究建立的"从脐带血到银发族"的全生命周期数据库,不仅为理解衰老轨迹提供新视角,其采用的 SPR 和 MMqPCR 等技术方案,更适合在资源有限地区推广应用。
这项研究的重要价值在于:首次证实新生儿期的表观遗传特征可预测后期衰老轨迹;建立首个包含印度人群特异的微生物组-衰老关联图谱;开发的便携式评估方案(结合可穿戴设备+指尖血检测)使社区筛查成为可能。正如作者指出,这种"年龄分型"(Ageotyping)策略,将为延缓衰老的个性化干预打开新大门。
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