深度学习与数字考古学联袂揭示新型驱蚊分子的发现之旅

【字体: 时间:2025年07月04日 来源:Chemical Senses 2.8

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  为解决传统驱蚊剂功效局限、安全性不足及物种特异性问题,Google Research与TropIQ Health Sciences团队通过数字化历史USDA数据集(约19,000项驱蚊数据),结合图神经网络(GNN)模型筛选317种候选分子,发现10余种效果优于DEET的驱蚊剂,并验证其跨物种有效性。该研究发表于《Chemical Senses》,为全球病媒控制提供高效计算筛选新范式。

  

每年虫媒疾病导致全球超50万人死亡,而现有驱蚊剂如DEET(N,N-二乙基-间甲苯甲酰胺)存在浓度需求高(>40%)、塑料腐蚀性及物种特异性(如IR3535对疟蚊无效)等缺陷。面对70年来仅少数新驱蚊剂上市的困境,Google Research联合华盛顿大学等机构创新性地融合数字考古学与深度学习技术,从尘封的USDA历史数据中挖掘出下一代驱蚊分子。

研究团队首先将1942-1947年间美国农业部(USDA)测试的约19,000项驱蚊数据(涉及Aedes aegypti和Anopheles quadrimaculatus蚊种)数字化,构建首个机器可读的驱蚊行为数据库。通过图神经网络(GNN)模型分析分子结构与驱蚊活性的关系,其预测性能(AUC=0.881)显著优于传统化学信息学模型。基于此,团队从eMolecules商业库中筛选317种候选分子,采用膜饲喂实验(anti-feedant assay)验证其驱避效果,发现49%候选分子在2分钟时驱避率>90%,其中TQ-0043503等10种分子在120分钟时仍保持>75%驱避率,效果超越DEET。

关键实验技术包括:1)基于GCaMP7s的蚊虫触角叶(AL)双光子钙成像技术,解析40种化合物对50个嗅小球(glomeruli)的神经响应模式;2)跨物种验证实验(A. stephensi、A. aegypti蚊及Ixodes scapularis蜱);3)人臂诱捕实验(arm-by-cage assay)评估皮肤挥发物环境下的实际效果。

结果部分
数字化历史数据集
USDA数据集经OCR转换与人工校验后,涵盖14,187种分子的皮肤/布料驱蚊数据。GNN模型在布料-A. aegypti任务中表现最佳(AUC=0.881),其学习表征(USDALR)使候选分子筛选准确率较传统方法提升23%。

驱蚊候选分子验证
膜饲喂实验显示,模型筛选分子与USDA历史数据驱避率显著相关(p<0.01)。在人体试验中,83%的膜饲喂阳性分子(如TQ-0043678)在13μg/cm2浓度下仍减少75%蚊虫着陆。

跨物种有效性
10种强驱避分子对A. aegypti(9/10有效)和蜱(10/10有效,ED50≈120μg/cm2)均表现广谱活性,打破IR3535等物种限制。

神经机制解析
钙成像揭示驱避剂(如DEET)可激活特定嗅小球(如glomeruli 18/19),但其响应模式与化学结构无直接关联(Spearman rho=0.29),暗示多通路驱避机制。

结论与意义
该研究首次实现历史数据驱动的驱蚊剂理性设计,突破传统“试错法”效率瓶颈。发现的醚类、苯环衍生物等新型驱避剂(Tanimoto距离USDA分子中位数0.48)为开发低浓度、可降解的下一代病媒控制产品奠定基础。蚊虫嗅觉通路的异质性响应(如glomeruli 2-8共抑制)为理解驱避剂神经编码提供新视角。未来可扩展至其他病媒(如采采蝇)及受体靶向筛选,加速全球公共卫生挑战的解决。


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