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基于环境DNA与宏基因组学的喜马拉雅淡水湖微生物群落分类功能解析与环境因子关联研究
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月05日 来源:The Nucleus 2.1
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来自印度的研究人员针对喜马拉雅高山湖泊生态系统微生物多样性监测难题,采用环境DNA(eDNA)和全宏基因组测序技术,揭示了达尔湖中变形菌门(Proteobacteria)为优势菌群(相对丰度51.71%-69.53%),通过KEGG/COG功能注释发现ABC转运蛋白等关键代谢通路,结合水质参数PCA分析证实pH和硝酸盐是驱动微生物群落变异的核心环境因子(解释率55.34%),为高海拔湖泊生态评估提供了分子生态学新范式。
在神秘的喜马拉雅淡水湖生态系统中,微生物王国正通过环境DNA(eDNA)技术揭开面纱。这项研究运用全宏基因组测序这把"分子显微镜",精准捕捉到达尔湖五个流域微生物群落的生命密码。
分类学图谱显示,变形菌门(Proteobacteria)以绝对优势统治着这片水域,从达尔盖特流域69.53%的"微生物霸权"到加格利巴流域51.71%的"殖民统治",紧随其后的是拟杆菌门(Bacteriodetes)、放线菌门(Actinobacteria)这些"微生物贵族"。功能注释则像一本微生物的"生存手册"——KEGG分析暴露了它们疯狂代谢的小秘密:细胞代谢、膜运输这些"基础生存技能"占据主导,而COG注释则暴露出ABC转运蛋白这类"分子快递员"的忙碌身影。
环境因子像是操纵微生物社会的"隐形推手"。主成分分析(PCA)显示pH值和硝酸盐这群"化学操盘手"掌控着55.34%的群落变异剧本,而电导率则在达尔盖特流域导演着独特的微生物选角大戏。特别有趣的是哈兹拉特巴流域,这里的微生物社区展现出令人惊讶的"生态平衡术",各类菌群在环境压力下展现出精妙的生存策略。
这项研究如同在喜马拉雅湖泊中安装了一套"微生物生态监测雷达",为高海拔脆弱生态系统的保护提供了全新的生物标记物体系。那些跳跃在短链脱氢酶(short chain dehydrogenase)和AMP结合酶(AMP-binding enzyme)之间的代谢火花,正在书写着极端环境下微生物适应的新篇章。
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