微波辅助绿色合成吡啶基-1,3,5-三嗪-2,4-二胺杂化体作为新型抗菌剂的创新研究

【字体: 时间:2025年07月05日 来源:BMC Chemistry 4.3

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  研究人员针对传统合成方法步骤繁琐、收率低且环境污染严重的问题,开发了一种微波辅助无溶剂一锅法高效合成吡啶基-1,3,5-三嗪-2,4-二胺杂化体的绿色工艺。通过分子对接和动力学模拟证实化合物6a/6g与脲酶(urease)活性位点稳定结合,其中6g对奇异变形杆菌(Proteus mirabilis)的MIC达6.25μg/mL,ADMET分析显示其具备良好成药性。该研究为开发新型抗菌剂提供了高效环保的合成策略和先导化合物。

  

微生物耐药性已成为全球健康危机,世界卫生组织2022年数据显示每年有超过3亿人遭受严重真菌感染,造成150万人死亡。传统抗菌药物面临耐药性增强和毒副作用等问题,亟需开发结构新颖、高效低毒的新型抗菌剂。1,3,5-三嗪(s-triazine)和吡啶作为优势药效团,其杂化结构可整合双重药理活性,但现有合成方法存在步骤冗长(需5步)、使用剧毒氰尿酰氯等问题。

南河谷大学联合德雷亚大学等机构的研究团队在《BMC Chemistry》发表研究,开发出微波辅助无溶剂一锅法合成吡啶基-1,3,5-三嗪-2,4-二胺杂化体的绿色工艺。该技术仅需15分钟反应时间,原子经济性达93.96%,收率最高达92%,较传统方法效率提升12倍。通过多组分反应将2-氨基吡啶、氰胺与芳香醛/酮在微波辐射下直接缩合,成功构建26个新型杂化体,其中化合物6g对奇异变形杆菌的抗菌活性尤为突出。

研究采用CLSI标准进行体外抗菌评价,结合分子对接(AutoDock Vina)和25ns分子动力学模拟(GROMACS)阐明作用机制,并通过PreADMET预测药代动力学性质。关键发现包括:1)化合物6g与脲酶活性位点形成稳定氢键(Arg339)和π-阳离子相互作用(Ni2+798),RMSD维持在3.5-4nm;2)疏水基团优化显著增强抗菌活性,2,5-二甲基苯基衍生物6g的MIC值较氯代衍生物6a降低50%;3)ADMET显示所有化合物胃肠道吸收率>77%,其中6g皮肤渗透性达-2.92(LogKp)。

化学合成优化
通过系统筛选反应参数确立最佳条件:2-氨基吡啶既作反应物又作碱催化剂,氰胺用量2当量,无溶剂微波120℃反应15分钟。该方案成功应用于芳香醛(3a-h)、酮(4a-c)和环己酮(5)等底物,收率70-92%。机理研究表明氰胺二聚生成氰基胍(9)后,与2-氨基吡啶缩合形成吡啶基双胍(10),再经醛酮缩合/环化构建三嗪核心骨架。

抗菌活性评价
测试菌株包括金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)、大肠杆菌(Escherichia coli)等5种病原体。结果显示:1)7b对肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae)的MIC=100μg/mL;2)6a/6g/8对奇异变形杆菌的MIC分别为12.5、6.25和6.25μg/mL;3)6c/7b/7c对白色念珠菌(Candida albicans)具抗真菌活性。

分子模拟研究
以4UBP(Bacillus pasteurii脲酶)为靶点,发现6g通过吡啶氮与Arg339形成氢键(S=-5.56kcal/mol),其甲基疏水口袋与Lys169/Ala170等残基产生稳定相互作用。MD模拟显示配体-蛋白复合物在20ns后RMSD稳定于0.99?,维持3-7个氢键,证实结合稳定性。

ADMET分析
所有化合物均显示:1)高HIA(77-94%);2)CNS活性(6a/6g的BBB<0.4);3)皮肤渗透性(LogKp=-3.59至-2.92);4)7a/7b对大鼠具致癌风险。

该研究创新性地将绿色化学理念贯穿药物开发全过程:1)开发原子经济性>93%的一锅法工艺;2)发现首个通过π-阳离子作用靶向脲酶Ni2+活性中心的吡啶基三嗪抑制剂;3)确立疏水基团(2,5-二甲基)对抗菌活性的关键影响。这些发现为应对微生物耐药性挑战提供了新思路,其绿色合成策略更对可持续药物研发具有示范意义。

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