
-
生物通官微
陪你抓住生命科技
跳动的脉搏
化学计量学驱动的药物毒性预测模型:基于QSAR/q-RASAR的人类安全风险评估
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月05日 来源:Journal of Hazardous Materials 12.2
编辑推荐:
为解决化学物质对人类健康的慢性毒性评估难题,研究人员开发了首个基于化学计量学的TDLo预测模型。通过整合QSAR(定量构效关系)和q-RASAR(定量跨读构效关系)方法,该研究建立了针对男性和女性的毒性预测框架,模型验证指标R2=0.622-0.651,Q2F1=0.677-0.680。SHAP分析揭示了关键分子描述符,为药物安全设计提供了可解释性工具,显著降低了动物实验依赖。
随着全球化学品使用量激增,人类通过饮水、空气和皮肤接触暴露于合成化学品的风险持续攀升。目前已有超过34万种化学物质投入使用,其中许多与内分泌紊乱、癌症和神经毒性密切相关。传统毒性评估依赖动物实验,每年耗费140亿美元且存在伦理争议,更因物种差异导致结果与人体实际反应偏差显著。尤其令人担忧的是,现有模型多聚焦急性毒性指标如LD50,而反映长期危害的TDLo(最低毒性剂量)预测工具始终空白。
针对这一关键问题,某大学研究人员在《Journal of Hazardous Materials》发表了突破性研究。团队首次构建了人类特异性TDLo预测模型,创新性地融合了QSAR(定量构效关系)和q-RASAR(定量跨读构效关系)方法。研究从TOXRIC数据库获取138例男性数据和120例女性数据,采用KNIME平台进行化学信息学处理,运用偏最小二乘回归(PLS)建立预测框架,并通过SHAP(沙普利加性解释)实现模型可解释性。
数据收集与准备
研究团队从TOXRIC数据库筛选258种有机化合物,经去重和缺失值处理后,提取0D-2D分子描述符。特别值得注意的是,该数据集首次纳入性别差异变量,为后续建立性别特异性模型奠定基础。
结果与讨论
q-RASAR模型展现出显著优势:男性数据集验证指标R2=0.651,女性数据集达0.622;外部验证Q2F1稳定在0.677-0.680区间。通过SHAP力场图分析,研究人员发现芳香环数量和氢键受体等结构特征对毒性影响最大。在DrugBank化合物验证中,模型成功识别出28种高风险药物分子。
实际意义与创新性
该研究突破性地实现了三点创新:首次建立人类TDLo预测模型、开发性别特异性评估工具、引入可解释AI技术。相比传统方法,模型将毒性筛查速度提升90%,成本降低至实验室方法的1/200。
局限性与展望
当前模型尚无法处理金属有机化合物,且对代谢产物的毒性预测存在局限。研究人员计划整合3D分子描述符和代谢通路数据,未来或可扩展至纳米材料风险评估领域。
环境健康启示
这项研究为环境污染物筛查提供了新范式。通过预测TDLo值,监管机构可优先管控高风险的持久性有机污染物,特别对饮用水源中农药残留的早期预警具有重要价值。
研究结论部分强调,该工作不仅填补了人类长期毒性预测的技术空白,更通过SHAP分析揭示了"分子结构-毒性"的定量关系。这种化学计量学驱动的方法,为21世纪绿色药物设计提供了关键决策工具,有望减少80%以上的动物实验需求。正如作者Shubha Das和Probir Kumar Ojha指出,这项技术将重塑从制药到环境监管的完整风险评估链条。
生物通微信公众号
知名企业招聘