茄子根系盐胁迫响应机制:转录组分析揭示关键基因与NAC转录因子的核心作用

【字体: 时间:2025年07月05日 来源:BMC Genomics 3.5

编辑推荐:

  本研究针对设施栽培中土壤盐渍化导致的茄子生长抑制问题,通过生理测定与转录组联合分析,首次系统揭示了耐盐品系ZH171根系在150 mM NaCl胁迫下的分子适应机制。研究发现盐胁迫诱导3491个差异表达基因(DEGs),其中氧化还原酶活性、戊糖醛酸互变途径及微管运动相关基因显著富集,并鉴定出NAC家族转录因子(如SmNAC2/48/62)作为核心调控元件参与离子稳态与渗透调节。该研究为茄子耐盐分子育种提供了关键靶点(如K+转运蛋白基因),发表于《BMC Genomics》,对茄科作物抗逆性改良具有重要指导意义。

  

研究背景
土壤盐渍化已成为设施蔬菜栽培的严峻挑战,尤其在茄子(Solanum melongena)这类经济作物中,过量施肥与连作导致次生盐渍化加剧。盐胁迫通过渗透失衡、离子毒性和活性氧(ROS)爆发三重机制抑制根系发育,其中Na+过量积累破坏K+/Na+平衡,干扰细胞代谢关键酶活性。尽管前期研究表明耐盐茄子品系可通过调节渗透物质(如脯氨酸)和抗氧化酶(如SOD、POD)缓解胁迫,但其根系响应盐胁迫的分子网络仍不清晰。

研究方法
河南省驻马店市农业科学院的研究团队以耐盐自交系ZH171为材料,采用150 mM NaCl处理4-6叶期幼苗根系24小时(水处理为对照)。通过生理指标检测(Na+/K+/Ca2+含量测定、ROS组织定位、MDA/脯氨酸含量、SOD/POD酶活)结合转录组测序(Illumina平台,参考基因组S. melongena V4.1),利用DESeq2筛选差异基因(|log2FC|>1, p<0.05),并通过GO/KEGG富集、转录因子注释及qRT-PCR验证关键基因。

研究结果
1. 盐胁迫诱导生理失衡与氧化损伤


盐处理24小时后,植株显萎蔫表型(图1A),根系H2O2与O2•?积累加剧(图1B),脯氨酸(渗透调节物质)和MDA(膜脂过氧化标志物)含量分别增加1.8倍和2.1倍(图1C-D),SOD与POD酶活显著提升(图1E-F),表明盐胁迫引发氧化损伤并激活抗氧化防御。

2. 转录组全局响应特征


转录组分析鉴定出3491个DEGs(1956个上调,1535个下调),主成分分析(PCA)显示处理组与对照组明显分离(图2)。表达模式聚类(图3A-B)揭示基因主要在胁迫后期(24小时)响应,其中氧化还原、水解酶活性相关基因富集度最高。

3. 功能通路富集分析


GO分析显示,DEGs显著富集于氧化还原酶活性(187个上调)、过氧化物酶活性(21个上调)及跨膜转运(图4)。微管运动相关基因(如微管结合蛋白MAPs)普遍下调(40个下调 vs 3个上调)(图5),暗示细胞骨架重构受抑制。KEGG通路中"戊糖醛酸互变"(Pentose and glucuronate interconversions)通路最为显著(图6),涉及34个上调基因(如果胶酯酶PME、多聚半乳糖醛酸酶PG)。

4. 离子稳态失衡与转运基因


ICP-OES检测显示,盐胁迫下根系Na+含量激增(p<0.05),K+与Ca2+无显著变化,导致K+/Na+比值从1.887骤降至0.056(图8)。转运蛋白基因中106个显著上调,包括12个K+相关基因(如K+通道蛋白)和21个Ca2+结合蛋白基因,提示离子转运重编程。

5. 转录因子调控网络


共鉴定236个TF差异基因,涵盖40个家族。NAC家族(18个上调)、ERF(14个上调)、bHLH(12个上调)及WRKY(12个上调)为关键调控因子(图9)。其中NAC家族基因(如SmNAC2/48/62)表达量增幅最大,可能通过激活渗透保护物质合成(如脯氨酸)维持离子稳态。

6. 关键基因实验验证


qRT-PCR验证8个氧化还原相关基因(*APX/PO
相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博
  • 急聘职位
  • 高薪职位

知名企业招聘

热点排行

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号