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首例蚤目Pygiopsyllidae科线粒体基因组揭示蚤类系统发育的不稳定性
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月06日 来源:Acta Parasitologica 1.2
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本研究首次对Aviostivalius klossi bispiniformis进行线粒体基因组测序,结合形态学描述,评估了Pygiopsyllidae科在蚤目(Siphonaptera)中的系统发育地位。研究人员采用Illumina NovaSeq 6000平台测序,结合最大似然法(ML)和贝叶斯分析(BI)构建系统发育树,发现该物种线粒体基因组具有79.7%高AT含量及独特的trnL2(UAA)基因9-bp反密码子环特征,揭示了Pygiopsyllidae科在蚤目中的不稳定分类地位,为蚤类进化研究提供了重要基因组学依据。
这项开创性研究解码了Aviostivalius klossi bispiniformis(蚤目Pygiopsyllidae科)的首个线粒体基因组,其18,669 bp的环形DNA展现出惊人的79.7% AT含量偏好。科研团队通过解剖显微镜(SZ2-ILST)完成形态学鉴定后,采用Illumina NovaSeq 6000高通量测序平台捕获了该跳蚤的完整遗传密码。
生物信息学分析揭示了两个关键特征:转运RNA基因trnL2(UAA)存在罕见的9碱基反密码子环结构,而nad4-nad4L基因重叠区达10 bp。当这些数据被输入系统发育重建模型时,无论是最大似然法(ML)还是贝叶斯推断(BI)都得出相同结论——Pygiopsyllidae科在蚤目进化树上的位置摇摆不定,就像跳蚤本身的弹跳轨迹般难以捉摸。
这项研究不仅填补了Pygiopsyllidae科基因组数据的空白,更如同一把遗传放大镜,暴露出当前蚤类系统发育研究的局限性:现有分类体系可能因样本覆盖不足而产生偏差。这些闪烁着AT碱基的遗传密码,正在重新定义我们对这些吸血昆虫进化史的理解。
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