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糖尿病肾病肾纤维化的关键标志物与治疗靶点:基于批量与单细胞RNA测序的多组学解析
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月06日 来源:Journal of Translational Medicine 6.1
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本研究针对糖尿病肾病(DKD)中肾小管间质纤维化的早期诊断和治疗难题,通过整合WGCNA、机器学习及单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术,构建了具有高预测效能的FibrosisScore模型,鉴定出促纤维化标志物PROM1(CD133)和抗纤维化因子THY1(CD90),并通过分子对接筛选出潜在治疗化合物ZINC402830/ZINC3830400。该研究为DKD的精准诊疗提供了新型生物标志物和靶向干预策略。
糖尿病已成为全球公共卫生危机,约40%的糖尿病患者会发展为糖尿病肾病(DKD),这是终末期肾病(ESRD)的首要病因。尽管现有疗法能延缓疾病进展,但多数患者仍不可逆地走向肾衰竭。传统生物标志物如尿蛋白和估算肾小球滤过率(eGFR)对早期病变不敏感,而肾小管间质纤维化作为DKD的核心病理特征,其分子机制尚未阐明。武汉大学的研究团队通过多组学整合分析,在《Journal of Translational Medicine》发表的研究揭示了DKD纤维化的关键驱动机制。
研究团队首先整合GSE30529和GSE104954两个批量RNA测序数据集,通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)锁定与DKD最相关的蓝色模块(MEblue),其791个基因与纤维化显著相关。结合Fibrotic Disease-associated RNAome数据库(FDRdb),筛选出22个差异表达的纤维化相关基因(DE-FRGs),包括CXCL6、MMP7等。利用单样本基因集富集分析(ssGSEA)构建的FibrosisScore模型,在训练集和验证集(GSE30122)中分别达到AUC 0.803和0.992的预测效能。
免疫特征与生物学通路分析
高FibrosisScore组呈现M2巨噬细胞主导的免疫抑制微环境,低分组则富集促炎性细胞。基因集变异分析(GSVA)显示WNT/β-catenin和IL6-JAK-STAT3通路激活是纤维化的关键驱动因素。
机器学习鉴定核心靶点
LASSO回归和随机森林算法交叉锁定PROM1和THY1为核心基因。单细胞测序揭示PROM1主要表达于近端小管细胞,而THY1富集于成纤维细胞。临床数据库分析显示PROM1与eGFR负相关(r=-0.57),THY1则正相关(r=0.52),提示二者在DKD中发挥拮抗作用。
分子机制与治疗探索
分子对接筛选出ZINC402830与PROM1结合能达-6.4 kcal/mol,ZINC3830400与THY1结合能为-6.0 kcal/mol。链脲佐菌素(STZ)诱导的DKD小鼠模型证实,PROM1促进α-SMA+肌成纤维细胞活化,而THY1过表达可减轻纤维化。
该研究首次阐明PROM1通过WNT/β-catenin通路促进肾纤维化,而THY1通过调控TGF-β/Smad信号发挥保护作用。发现的FibrosisScore模型和候选化合物为DKD的早期诊断和靶向治疗提供了新策略,特别是针对非蛋白尿型DKD患者的临床管理具有重要转化价值。研究局限性在于尚未开展化合物体内功能验证,未来需通过类器官模型和临床试验进一步验证其疗效。
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