
-
生物通官微
陪你抓住生命科技
跳动的脉搏
基于生物信息学设计的新型多表位胶质母细胞瘤疫苗:靶向PLAUR、ITGB3及HLA分子的免疫治疗策略
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月06日 来源:Scientific Reports 3.8
编辑推荐:
本研究针对胶质母细胞瘤(GBM)这一最具侵袭性的原发性脑肿瘤,通过生物信息学方法设计了一种靶向PLAUR、ITGB3及HLA-I类分子的多表位疫苗。研究人员筛选出36个CTL表位和14个Th表位,构建的疫苗具有高抗原性(VaxiJen评分0.6314)、非过敏性和稳定性(半衰期30小时),分子对接与300ns分子动力学模拟证实其与TLR4强结合(能量-918.2 kcal/mol),免疫模拟显示可诱导IFN-γ和IL-2显著升高。该研究为GBM免疫治疗提供了新思路。
胶质母细胞瘤(GBM)是成人中最致命的脑肿瘤,患者五年生存率不足5%。尽管手术联合放化疗是标准疗法,但中位生存期仅12-18个月。近年来,靶向EGFRvIII和IDH1的疫苗临床试验接连受挫,亟需开发新策略。多伦多大学的研究团队另辟蹊径,通过生物信息学筛选GBM特异性表面抗原,设计出新型多表位疫苗,相关成果发表于《Scientific Reports》。
研究采用免疫信息学技术,基于TCGA数据库筛选出PLAUR、ITGB3、HLA-B和HLA-A四个高表达于GBM的突变表面蛋白。通过VaxiJen、AllerTOP等工具评估表位特性,最终选用3个CTL表位(C1-C3)和1个Th表位(H1),以AAY/EAAAK linker连接并添加L7/L12佐剂。300ns分子动力学模拟验证疫苗-TLR4复合物稳定性,C-ImmSim预测其可激活B/T细胞免疫应答。
靶点选择与初步分析
通过TCGA数据证实四个靶基因在GBM中显著过表达(p<0.05),且高表达患者生存率更低。突变分析显示PLAUR(His替换Arg)、ITGB3(Asp替换Asn)等位点具有免疫原性。
疫苗构建
核心结构为C1(AQTTKRKWE)-C2-C3串联,通过AAY linker分隔,H1(DMAAQTTKRKWEAAH)作为Th表位。N端连接佐剂后总长186aa,分子量19.88kDa,pI 5.7,二级结构中α-螺旋占79.03%。
抗原性与稳定性验证
疫苗抗原性评分(ANTIGENpro 0.9399),非过敏原性,不稳定指数24.96(<40属稳定蛋白)。ProTSAV评估显示Model 2质量最佳(C-score -2.74)。
B细胞表位预测
发现3个线性表位(如AKAQTTK)和5个不连续表位(最高分0.826),ElliPro分析证实表位位于疫苗表面。
TLR4相互作用
ClusPro 2.0对接显示疫苗与TLR4形成15个氢键和4个盐桥(如Arg152-Glu286),结合能-918.2 kcal/mol。MD模拟中复合物RMSD稳定在11?,显著低于游离疫苗(22?)。
免疫模拟
三次免疫后IgG1+IgG2提升8倍,记忆B/T细胞持续增加,NK细胞活性增强。IFN-γ和IL-2峰值浓度较基线提高5倍。
该研究创新性地靶向GBM特异性表面抗原,克服了传统细胞内靶点(如IDH1)的递送难题。疫苗设计整合了CTL/Th协同激活策略,并通过TLR4通路增强免疫应答。虽然仍需实验验证,但该计算模型为个体化GBM疫苗开发提供了新范式,特别是针对PLAUR这一与肿瘤侵袭、耐药相关的重要靶点。研究团队建议后续采用其开发的穿透血脑屏障的纳米颗粒递送系统,可能进一步提升疫苗疗效。
生物通微信公众号
知名企业招聘