埃及尼罗河三角洲地区携带表皮剥脱毒素基因etA的耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(LA-MRSA)的流行及其公共卫生意义

本研究针对埃及尼罗河三角洲地区新出现的携带表皮剥脱毒素基因etA的CC15型耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(LA-MRSA)展开调查。通过全基因组测序和分子流行病学分析，研究人员发现该菌株携带多重耐药基因和致病性噬菌体，可能增加人类感染风险，特别是新生儿接触污染牛奶后的严重皮肤综合征(SSSS)风险。研究呼吁加强埃及及周边地区的病原监测。

　　

金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)这个常见的"机会主义者"正在全球范围内引发新的健康威胁。近年来，一种特殊的耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)在埃及尼罗河三角洲地区的牲畜和农民中悄然传播，它不仅携带多种抗生素耐药基因，还获得了一种危险的"武器"——编码表皮剥脱毒素A的etA基因。这种毒素能导致严重的葡萄球菌性烫伤样皮肤综合征(SSSS)，在新生儿中可能致命。更令人担忧的是，这种被称为CC15-MRSA-[V+fusC]的菌株已从沙特阿拉伯扩散至埃及，可能通过污染的牛奶传播给人类。

为了揭示这一新型病原体的特征，来自德国莱布尼茨光子技术研究所等机构的研究团队开展了一项系统研究。研究人员收集了2022年埃及尼罗河三角洲地区134株MRSA分离株，采用DNA微阵列分型技术进行初步筛查，随后对携带etA基因的菌株进行牛津纳米孔测序。研究还通过噬菌体诱导实验和透射电镜观察，确认了etA基因的噬菌体载体特性。

研究方法
研究团队首先从埃及尼罗河三角洲地区的牲畜和农民中收集样本，通过选择性培养和生化鉴定获得MRSA分离株。关键实验技术包括：1)DNA微阵列分析134株MRSA的耐药基因和毒力因子；2)牛津纳米孔技术对携带etA基因的菌株进行全基因组测序；3)丝裂霉素C诱导噬菌体释放并提取噬菌体DNA；4)透射电镜观察噬菌体形态特征；5)生物信息学分析比较基因组特征。

结果
Emergence of CC15-MRSA-[V+fusC] in Egypt
在134株MRSA中，28株(20.9%)被鉴定为CC15-MRSA-[V+fusC]，成为该地区第二常见的MRSA谱系。其中20株携带etA基因，这些菌株主要分离自患乳腺炎的小型反刍动物乳汁和农民。

Characterization of the SCCmec element
基因组分析揭示了一个复杂的SCCmec V型元件，包含mecA、fusC和aacA-aphD等耐药基因。该元件与沙特阿拉伯原始菌株高度相似，证实了其传播路径。

The recombinant hsdM/S-ssl(vSaa) locus
所有埃及分离株均显示出hsdM/S-ssl基因座的重组特征，这一特征也存在于沙特和科威特菌株中，提示它们具有共同祖先。

Analysis of the prophage sequences
etA基因位于一个整合在sufB基因旁的噬菌体上，经形态学和基因组分析归类为Phietavirus属。这是首次在CC15-MRSA中发现etA噬菌体。

Phage morphology analysis
电镜观察显示，诱导的噬菌体包括头部直径约60nm的二十面体颗粒(Phietavirus)和头部长度约90nm的长形颗粒(Triavirus)。

结论与意义
这项发表在《European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases》的研究首次报道了携带etA基因的CC15-MRSA在埃及的流行。该菌株具有多重耐药性，对β-内酰胺类、夫西地酸、庆大霉素/妥布霉素、林可酰胺类和四环素等多种抗生素耐药。更重要的是，其携带的etA基因可能显著增加人类感染风险，特别是可能导致新生儿SSSS。

研究揭示了该菌株可能的进化路径：最初在沙特阿拉伯获得SCCmec/SCCfus复合元件，随后传播至埃及并获取etA噬菌体。由于埃及地区抗生素使用广泛且感染控制措施有限，这种"超级细菌"可能进一步扩散。研究人员强烈建议加强对SSSS病例的监测，特别是对有埃及旅行史的人群。这项研究为理解MRSA的跨物种传播和毒力进化提供了重要线索，对公共卫生防控具有重要指导意义。